Nanopore データ、Megalodon から phasing まで
1. ONT、basecalling & mapping
<環境 GPU ノード>
Intel Xeon Gold 6326 CPU 2.90GHz x 2, 256GB memory
NVIDIA GA100 [A100 PCIe 40GB] x 4
Rocky Linux release 8.5
megalodon v2.5.0 (https://github.com/nanoporetech/megalodon)
Remora v2.0.0
guppy v6.4.2