結局ノートパソコンのスタイラスペンの挙動が怪しいので、カーソル表示をオフにして対処しました。
ソフトによっても相性がありそうなので何とも言えないですが、カーソルが荒ぶったりする場合は表示をオフにした方がまだ安定して使えています。