iSMOD: an integrative browser for image-based single-cell multi-omics data

iSMOD: an integrative browser for image-based single-cell multi-omics data

1. この研究の学術的な背景と、研究課題の核心をなす学術的「問い」は何ですか？
- 答え：この研究の背景は、遺伝子の調節における染色質、mRNA、タンパク質の空間的位置に関連した情報を得るために、DNAとRNAのFISH法によるゲノムとトランスクリプトームイメージングデータの収集が必要であることから生じたものである。研究課題の核心的な問いは、イメージベースのマルチオミックスデータ解析の手法について、どのように改善していくことができるかということである。

2. 本研究の目的及び学術的独自性と創造性は何ですか？
- 答え：本研究の目的は、イメージベースのゲノム、トランスクリプトーム、タンパク質データを含むUMI/FISH法に関するマルチオミックスデータの収集に役立つ最初のインテグレーティブブラウザであるiSMODの開発である。これにより、異なる多様な研究成果を統合し、研究に新たな視点をもたらすことが期待される。

3. 本研究の着想に至った経緯や、関連する国内外の研究動向と本研究の位置づけは？
-答え: 本研究の着想は、ゲノム、トランスクリプトーム、タンパク質に関してマルチオミックスデータを収集および解析するための現状の課題によって生じたものである。iSMODにより、これらのデータを統合的に収集して解析することができ、研究成果の拡充や高度な解析が可能になる。

4. 本研究で何をどのように、どこまで明らかにした？
- 答え: 本研究で明らかにされたのは、iSMODがタイトル、要約、実験図を基にFISHおよび核プロテオミクスデータを収集してブラウジングする最初のインテグレーティブブラウザであり、マルチオミックスデータを統合的に収集・解析することができるということである。

5. 本研究の有効性はどのように検証した？
- 答え: 本研究では、iSMODの各種機能を用いて複数の研究成果を統合・解析し、新たなデータの提供・解析が可能であることを示した。iSMODは、分野を超えた研究に対する新しい解析法を可能にするため、研究成果を高度に洞察することができる。