MIST-CF: Chemical formula inference from tandem mass spectra

MIST-CF: Chemical formula inference from tandem mass spectra

1. この研究の学術的な背景、研究課題の核心をなす学術的「問い」は何ですか？

• 答え：この研究の学術的背景は、代謝物未知検出時の化学式注釈付けにおける問題である。研究課題の中心的な「問い」は、MS/MSによるデータ駆動学習を用いて、未注釈のMS/MSスペクトルに対して化学式と添加物の割り当てを行う手法やモデルの開発に関するものである。

1. 本研究の目的及び学術的独自性と創造性は何ですか？

• 答え：本研究の目的は、MS/MSによるデータ駆動学習を用いて、未注釈のスペクトルに対して化学式と添加物の割り当てを行う手法やモデルの開発である。独自性と創造性は、既存の最先端のモデルと比較して、10％のトップ1精度の向上を実現することにある。また、フラグメントツリーの構造化に依存しない学習を可能とすることでも注目される。

1. 本研究の着想に至った経緯や、関連する国内外の研究動向と本研究の位置づけは何ですか？

• 答え：従来は、代謝物の構造の解析には放射光、核磁気共鳴、または質量分析計などの高価な装置が必要であった。近年、この解析手法にMS/MSが導入され、未知の化合物の構造解析に広く使用されている。本研究では、MS/MSによる未知化合物の化学式注釈付けのためのモデルの構築を通じて、データ駆動学習の可能性を示した。

1. 本研究で何をどのように、どこまで明らかにした？

• 答え：本研究では、MIST-CFというモデルを導入し、未知のMS/MSスペクトルに対して、適切な化学式と添加物の選択を学習可能な仕組みを構築した。また、モデルの精度を改良するために、データ駆動学習による化学式および添加物の選択学習を行い、大きなデータベースを使用してモデルの有効性を検証した。

1. 本研究の有効性はどのように検証した？

• 答え：本研究では、既存の化学式注釈付け手法よりも10％のトップ1精度の向上を達成し、CASMI2022挑戦データセットでも優れた結果を示した。この実験結果により、未知のMS/MSスペクトルに対する化学式の予測において、魅力的な方法として、データ駆動学習の利用可能性が示唆された。