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古代のDNAが黒死病の起源を追跡。

キルギス(Kyrgyzstan)の墓から発見されたペスト菌は、中世に大流行したペスト菌の直接の祖先であることがゲノムから明らかになった。

Nature Briefingは2022年06月16日に、シルクロードの中継地は、人類にとって最も破壊的なパンデミックの震源地であったかもしれない。

現在のキルギス(Kyrgyzstan)で14世紀に発生したペストの大流行で死亡した人々は、ペストを引き起こすバクテリアであるエルシニア・ペスティス(Yersinia pestis)の株によって殺されており、その数年後に黒死病(Black Death)を引き起こす病原体を生み出したことが、古代ゲノムの研究によって明らかになったのである。

https://time-az.com/main/detail/77101

確かに、古文書では、ペストの後に、黒死病が出現している。

「コロナウイルスで言えば、アルファ、デルタ、オミクロンがすべて武漢の菌株から生まれたように、すべての菌株が集まっている場所を見つけるようなものです」と、ドイツ・ライプチヒのマックス・プランク進化人類学研究所の古遺伝学者ヨハネス・クラウス(Johannes Krause, a palaeogeneticist at the Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology in Leipzig, Germany)は言う。

1346年から1353年にかけて、黒死病がユーラシア大陸西部を荒廃させ、場所によっては人口の60%までが死亡した。歴史的な記録によると、ペストは東方から発生したようである。クリミア半島のカファ(Caffa, on the Crimean peninsula)では、1346年にモンゴル帝国軍に包囲された際にペストが発生したことが記録されている。コーカサス地方や中央アジアの他の地域が震源地となる可能性が指摘されている。

中国には、世界で最も多様なY. pestisの現代株があり、黒死病の起源が東アジアにあることを示唆している。「文献上ではあらゆる種類の仮説があった。しかし、黒死病がどこから来たのか、正確には分かっていなかったのです。」とクラウスは言う。

ペストの痕跡
数年前、イギリスのスターリング大学の経済・環境史研究者であり、この研究の共同執筆者であるフィリップ・スラヴィン(Philip Slavin, an economic and environmental historian at the University of Stirling, UK)は、キルギスの14世紀の2つの墓地から、黒死病の起源を知る手がかりになるかもしれないと思う記録を発見した。この墓地はカラジガチ(Kara-Djigach)とブラナ(Burana)と呼ばれ、1338年と1339年の墓石が異常に多く、そのうちの10基が疫病について明確に言及していたのである。

フィリップ・スラヴィンは記者会見で、「1年か2年に死亡率が高いということは、何かおかしなことが起こっているということだ」と述べた。

フィリップ・スラヴィンは、この埋葬が後の黒死病と関係があるかどうかを調べるために、ヨハネス・クラウスと協力して、1880年代と1890年代に発掘され、ロシアのサンクト・ペテルブルグ(St Petersburg, Russia)に移されたキルギスの墓地から、遺骨を探し出すことに成功した。ドイツのチュービンゲン大学の考古遺伝学者マリア・スピルーが率いるチーム(The team, led by archaeogeneticist Maria Spyrou at the University of Tübingen, Germany)は、遺骨を回収した7人の古代のDNAを解読し、カラジガチ(Kara-Djigach)の3つの埋葬からY. pestis DNAを発見した。

このデータから得られた1対のY. pestisフルゲノムから、この細菌が黒死病に関連する菌株の直接の祖先であることが判明した。また、カラ-ジガッハ株は、現在流通している大半のY. pestis系統の祖先でもある。これは、黒死病の直前にY. pestisの多様性が爆発的に増加したことを示している、とヨハネス・クラウス教授は述べている。「黒死病の直前にY. pestisの多様性が爆発的に増加したことを示している。

黒死病の起源は、この中央アジアにあるとする証拠が他にもある。現代のY. pestis菌の株の中で、キルギス(Kyrgyzstan)、カザフスタン(Kazakhstan)、中国北西部の天山山脈を囲む新疆(Xinjiang in northwest China, surrounding the Tian Shan mountain)でマーモット(marmots)やその他のネズミから採取されたものは、カラ-ジガチ株に最も近いものであった。「あの村だ、あの谷だと言うことはできませんが、あの地域である可能性は高いでしょう」ととヨハネス・クラウス教授は言う。

ペスト菌は齧歯類(Rodents)が保菌者で、ヒトはノミなどの媒介者から感染して初めてペストになる。
ヨハネス・クラウス教授は、ヨーロッパで免疫のないネズミが黒死病を引き起こしたのに対し、キルギスでは感染したマーモットと人間が密接に接触したことが流行のきっかけになったのではないかと推測している。

天山は黒死病の震源地として理にかなっているとフィリップ・スラヴィンは言う。キルギスの墓からはインド洋の真珠、地中海の珊瑚、外国のコインなどが発見されており、遠くの品物がこの地域を通っていたことがうかがえる。「遠距離交易と地域交易の両方が、病原体を西方に広げるのに重要な役割を果たしたに違いないと推測できます」とスフィリップ・スラヴィンは言う。

中世の「死亡証明書(death certificates)」
アリゾナ州フェニックスに住む中世の歴史学者で独立研究者のモニカ・グリーン(Monica Green, a medieval historian and independent scholar in Phoenix, Arizona)は、「黒死病の祖先であるペスト菌からゲノムを得たことは、とてつもないブレークスルーだ」と言う。墓石は「死亡証明書」に限りなく近いものです。ですから、このY. pestisの系統は当時から存在していたことが分かります。」しかし、彼女は、ペストの "ビッグバン "が1338-39年のキルギスの死の頃に起こったというこの研究の結論には、あまり自信がない。
モニカ・グリーンは、遺伝学的、生態学的、歴史的証拠に基づいて、13世紀のモンゴル帝国の拡大が、後の黒死病の原因となるY. pestis株の拡散と多様化を促進したという仮説を立てている。

コロンビアにあるサウスカロライナ大学の生物考古学者であるシャロン・デウィット(Sharon Dewitte, a bioarchaeologist at the University of South Carolina in Columbia)は、この研究は黒死病とその一部である第二次ペスト大流行と呼ばれる大流行を、ヨーロッパを超えて研究する扉を開くものであると言う。彼女は、カラジガチのペストで死亡した人々の人口統計学的パターンや死亡率パターンを、ヨーロッパの黒死病墓地のものと比較することを熱望している。

コペンハーゲン大学の計算生物学者で、古代のY. pestisの配列を解析しているサイモン・ラスムセン(Simon Rasmussen, a computational biologist at the University of Copenhagen)は、「古代アジアや中国からのペストサンプルが増えれば、第1次、第2次ペスト大流行の起源がアジアにあるという証拠をさらに追加する意味で、非常に興味深いものになるでしょう。」と付け加えている。

ヨハネス・クラウス教授は、「我々は東洋のストーリーを知りたいのです。」と言い。中国からの遺骨を分析して、ヨーロッパに大きな傷をつけたパンデミックが東アジアでどのように反響したかを調べたいと考えているという。

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