今更ながら、クリスタEXの書き出しウィンドウ「出力範囲」にて「選択範囲」という選択肢があることに気付きましたので記事に追記しました…！
いや、選択範囲出したまま書き出ししませんて…（汗）
https://dentakumanga.com/clipstudiopaint-export/