ベイズ統計モデリングパッケージ　pymc

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ベイズ統計モデリングを扱うpymcをcondaを使ってインストールした。
pymcは、バックエンドでCのコードを使い、またGPUでもモデルを走らせることができ、実行速度の向上を可能にする。
　インストールは以下のコマンドを使った。

conda create -c conda-forge -n pymc_env "pymc>=5"
conda activate pymc_env

　Jupyter notebook上で使えるように、カーネルを作成した。

python -m ipykernel install --user --name=pymc_env

　この環境を設定しないと、lapackのライブラリが見つからないとエラーが出るので注意。
　また線形モデルの解析には、bambiを使う。
　次のコードでbambiがインストールされていない場合は、インストールできる。

import sys

try:
    import bambi as bmb
except ImportError:
    !{sys.executable} -m pip install --upgrade bambi
    import bambi as bmb