細菌免疫系に感受性を与えるファージ決定基の発見

2023年9月7日 16:04

メインコンテンツへスキップ
セル
ログイン

論文|186巻9号、p1863-1876.e16、2023年4月27日

全号ダウンロード
細菌免疫系に感受性を与えるファージ決定基の発見

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674%2823%2900172-1

アビゲイル・ストカー＝アヴィハイル
タヤ・フェドレンコ
イェンス・ヘア
サラ・メラメド
ギル・アミタイ
ロテム・ソレク 2
すべての著者を表示

脚注を表示発行:2023年04月07日DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.02.029
PlumXメトリクス

ハイライト

細菌免疫から逃れたファージ変異体により、感染がどのように検出されるかが明らかになった

多様な防御システムが同じファージ成分を感知するように収束した

複数のレトロン防御システムに対するファージ・トリガーの発見

5つの頓挫的感染システムとその引き金となるファージタンパク質の発見
まとめ
ここ数年の間に、細菌において多数の抗ファージ防御システムが発見されている。これらの防御システムのいくつかはそのメカニズムが解明されているが、未解決の主要な問題は、これらのシステムがファージ感染をどのように感知するかということである。この疑問を系統的に解決するために、我々は15の異なる防御システムから逃れる177のファージ変異体を単離した。多くの場合、これらのエスケーパーファージは防御システムが感知する遺伝子に変異があり、細菌免疫に対する感受性を与えるファージの決定基をマッピングすることができた。我々のデータは、多様なレトロン・システムの特異性決定因子を同定し、ファージがコードする複数の感染システム中止のトリガーを明らかにした。ファージ感知における一般的なテーマを見出し、機構的に多様なシステムが、ファージのコア複製機構、ファージの構造構成要素、または宿主の乗っ取り機構のいずれかを感知するように収束していることを実証した。我々のデータをこれまでの知見と組み合わせることで、細菌免疫系がどのようにファージ侵入者を感知するのかについて、重要な原則を定式化することができる。

図解抄録
図サムネイルfx1
大きな画像を見る高解像度画像をダウンロードする
キーワード
抗ファージ
Ec48
エコ8
Ec67
レトロン
msDNA
RecBCD
不完全感染
細菌防御
細菌免疫
ファージ耐性
ファージ誘因
ファージ感受性決定因子
エスケープファージ
エスケーパーファージ
この記事の全文を読むには、お支払いが必要です。
1回限りのアクセスを購入する：
アカデミック＆パーソナル：24時間オンラインアクセス
企業の研究開発担当者：24時間オンラインアクセス
今すぐ読む
HTML記事全文へのアクセスを6時間または36時間、低料金でご購入いただけます。こちらをクリックしてください。

1回限りのアクセス料金
購読する
Cellを購読する
既に冊子版をご購読の方オンライン・アクセスを申し込む
オンライン購読をご希望の方サインイン
登録するアカウントを作成する
機関アクセス ScienceDirectにサインイン
参考文献
ミルマンA.
メラメド S.
リービットA.
ドロンS.
ベルンハイムA.
ヘルJ.
ガーブ J.
ベション N.
ブランディス A.
ロパティナA.
他。
ファージから細菌を守る免疫システムの拡張アーセナル。
Cell Host Microbe. 2022; 30: 1556-1569.e5
https://doi.org/10.1016/j.chom.2022.09.017
記事で見る
スコパス (36)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
クズメンコ A.
オギエンコ A.
Esyunina D.
ユーディンD.
ペトロワ M.
クディノワ A.
マスロワ O.
ニノワ M.
リャザンスキー S.
リーチD.
他
細菌のアルゴノート・ヌクレアーゼによるDNA標的化と干渉。
Nature. 2020; 587: 632-637
https://doi.org/10.1038/S41586-020-2605-1
記事で見る
日本学術振興会特別研究員 (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ガーブJ.
ロパティナ A.
ベルンハイムA.
ザレンバ M.
シクスニスV.
メラメド S．
リービットA.
ミルマン A.
アミタイ G.
ソレックR.
複数のファージ耐性システムは、SIR2依存性のNAD+枯渇を介して感染を阻害する。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 1849-1856
https://doi.org/10.1038/s41564-022-01207-8
論文で見る
スコープス (23)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ザレンバ M．
ダキネヴィシエネD.
ゴロヴィナス E.
ザゴルスカイテ E.
スタンクナス E.
ロパティナ A.
ソレク R.
マナコバ E.
ルクセナイト A.
シランスカスA.
他
短い原核生物のアルゴナウテスは、NAD+の枯渇を通じて、侵入してくる移動性遺伝要素に対する防御を提供する。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 1857-1869
https://doi.org/10.1038/s41564-022-01239-0
論文で見る
スコープス (17)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
クーパルB.
ポトニックA.
ムッテ S.K.
アパリシオ・マルドナードC.
Lindhoud S.
ヴェルヴォート J.J.M.
ブラウンス S.J.J.
Swarts D.C.
原核生物の短いアルゴノート・システムは、侵入してきたDNAを検出すると細胞死を引き起こす。
Cell. 2022; 185: 1471-1486.e19
https://doi.org/10.1016/J.CELL.2022.03.012
記事で見る
麹菌 (0)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
クロンハイム S.
ダニエル-イヴァドM.
ドゥアン Z.
ホワン S.
ウォン A.I.
マンテル I.
ノドウェル J.R.
マックスウェル K.L.
ファージ感染に対する化学的防御
Nature. 2018; 564: 283-286
https://doi.org/10.1038/S41586-018-0767-X
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ベルンハイムA.
ミルマンA.
オフィールG.
メイタフG.
Avraham C.
ショマール H.
ローゼンバーグ M.M.
タル N.
メラメド S．
アミタイG.
ら
原核生物の毒蛇は多様な抗ウイルス分子を産生する。
Nature. 2021; 589: 120-124
https://doi.org/10.1038/s41586-020-2762-2
記事で見る
スコパス (84)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Kever L.
ハーディ A.
ルテT.
ヒュンネフェルト M.
ゲーゲンス C.
ミルケ L.
ヴィヒャート J.
ヴィットマン J.
モラル C.
マリエンハーゲンJ.
他。
アミノグリコシド系抗生物質は、感染サイクルの初期段階を阻害することによりファージ感染を阻害する。
mBio. 2022; 13: e0078322
https://doi.org/10.1128/MBIO.00783-22
論文で見る
麹菌 (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
タル N.
ミルマンA.
ストカール-アビハイルA.
フェドレンコT.
リービットA.
メラメド S.
イルミヤ E.
アブラハム C.
ブランディス A.
メールマンT.
他。
細菌はバクテリオファージ感染を防御するためにデオキシヌクレオチドを枯渇させる。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 1200-1209
https://doi.org/10.1038/s41564-022-01158-0
論文で見る
スコープス (20)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オフィールG.
ハーブストE.
Baroz M.
コーエン D.
ミルマンA.
ドロン S.
タル N．
マルヘイロ D.B.A.
マリツキー S．
アミタイG.
他
免疫シグナル分子を介した細菌TIRドメインの抗ウイルス活性。
Nature. 2021; 600: 116-120
https://doi.org/10.1038/S41586-021-04098-7
論文で見る
スコープス (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
シューB.Y.
セヴリンG.B.
エルグC.A.
ウォルドロン E.J.
カント A.
ウェッセル A.J.
ドーバーJ.A.
ローデス C.R.
ライデンハワー B.J.
ペアレントK.N.
他
デアミナーゼを介したデオキシヌクレオチドの枯渇による細菌内のファージ防御。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 1210-1220
https://doi.org/10.1038/s41564-022-01162-4
論文で見る
スコープス (13)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
コーエン D．
メラメド S.
ミルマンA.
シュルマンG.
オッペンハイマー・シャーナン Y.
カセン A.
ドロン S.
アミタイ G.
ソレックR.
サイクリックGMP-AMPシグナルが細菌をウイルス感染から守る。
Nature. 2019; 574: 691-695
https://doi.org/10.1038/s41586-019-1605-5
論文で見る
スコープス (219)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
タル N.
モアハウスB.R.
ミルマンA.
ストカール-アビハイルA.
アブラハムC.
フェドレンコ T.
イルミヤ E.
ハーブスト E.
ブランディス A.
メールマンT.
他
環状CMPと環状UMPはファージに対する細菌免疫を媒介する。
Cell. 2021; 184: 5728-5739.e16
https://doi.org/10.1016/J.CELL.2021.09.031
論文で見る
(0件)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ホワイトリーA.T.
イーグルシャムJ.B.
デ・オリベイラ・マンC.C.
モアハウスB.R.
ローイ B.
ニエミネン E.A.
ダニルチャンカ O.
キング D.S.
リー A.S.Y.
メカラノスJ.J.
ほか
細菌cGAS様酵素は多様なヌクレオチドシグナルを合成する。
Nature. 2019; 567: 194-199
https://doi.org/10.1038/s41586-019-0953-5
論文で見る
スコープス (170)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ミルマンA.
ベルンハイムA.
ストカール-アビハイルA.
フェドレンコT.
ヴォイチェクM.
リービット A.
オッペンハイマー・シャーナン Y.
ソレックR.
抗ファージ防御における細菌レトロンの機能。
Cell. 2020; 183: 1551-1561.e12
https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.09.065
論文で見る
スコープス (114)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ボボニスJ.
ミトシュ K.
マテウス A.
カーチャー N.
クリティコスG.
セルクリグ J.
ジーテック M.
モンゾン V.
ファルツ B.
ガルシア-サンタマリーナS.
他
細菌レトロンは、ファージを防御する3つの毒素-抗毒素系をコードする。
Nature. 2022; 609: 144-150
https://doi.org/10.1038/s41586-022-05091-4
論文で見る
麹菌
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Gao L.
アルテ・トラン H.
ベーニングF.
マカロワ K.S.
セーゲル M.
シュミット・バーグ J.L.
クーブ J．
ウルフ Y.I.
クーニン E.V.
チャン F.
多様な酵素活性が原核生物の抗ウイルス免疫を媒介する。
Science. 2020; 369: 1077-1084
https://doi.org/10.1126/science.aba0372
論文で見る
スコープス (142)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ゴールドファーブ T．
スベロH.
ワインストックE.
コーエンO.
ドロン S.
シャルパック・アミカム Y.
アフィック S.
オフィール G.
ソレックR.
BREXは微生物ゲノムに広く存在する新規ファージ耐性システムである。
EMBO J. 2015; 34: 169-183
https://doi.org/10.15252/embj.201489455
論文で見る
スコープス (268)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オフィールG.
メラメド S.
スベロH.
ムカメルZ.
シルバーマン S.
ヤーコフ G.
ドロン S.
Sorek R.
DISARMは広範な抗ファージ活性を持つ細菌防御システムである。
Nat. Microbiol. 2018; 3: 90-98
https://doi.org/10.1038/s41564-017-0051-0
論文で見る
スコープス (157)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ドロンS.
メラメドS.
オフィールG.
リービットA.
ロパティナA.
ケレン M.
アミタイ G.
ソレックR.
微生物パンゲノムにおける抗ファージ防御システムの系統的発見。
Science. 2018; 359: eaar4120
https://doi.org/10.1126/science.aar4120
論文で見る
スコープス (460)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ジョンソン A.G.
ヴァインT.
メイヤー M.L.
ダンカン-ローウィーB.
イルミヤ E.
オッペンハイマー・シャーナン Y.
アミタイ G.
ソレク R．
クランズシュ P.J.
細菌性ガスダーミンは古代の細胞死メカニズムを明らかにした。
Science. 2022; 375: 221-225
https://doi.org/10.1126/SCIENCE.ABJ8432
論文で見る
スコープス (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ルセット F.
ドパルデューF.
ミーレS.
ダウディング J.
ラヴァル A.L.
リーバーマン E．
ギャリー D．
ロシャ E.P.C.
ベルンハイム A．
ビカードD.
ファージとそのサテライトは抗ウイルスシステムのホットスポットをコードする。
Cell Host Microbe. 2022; 30: 740-753.e5
https://doi.org/10.1016/j.chom.2022.02.018
論文で見る
スコパス(47)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
バサロ C.N.
ドーリングC.R.
リトルヘイル M.L.
テオドロ G.I.C.
ラウブ M.T.
大腸菌のパンゲノムから、これまで検出されていなかった抗ファージ防御システムが機能選択によって明らかになった。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 1568-1579
https://doi.org/10.1038/s41564-022-01219-4
論文で見る
スコープス (29)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バーリ S.M.N.
周正L.
ハウエルO.
ホセイン M.
ヒル C.M.
ボイル T.A.
ケーター K.
ダンドゥ V.S.
トーマス A．
アスランB.
他
多機能性細菌酵素による核酸免疫のユニークな様式。
Cell Host Microbe. 2022; 30: 570-582.e7
https://doi.org/10.1016/J.CHOM.2022.03.001
論文で見る
麹菌 (0)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ドパルデュー F.
ディディエ J.-P.
ベルンハイム A.
シャーロック A.
モリーナ H.
デュクロ B.
ビカード D.
真核生物様セリン・スレオニンキナーゼがブドウ球菌をファージから守る。
Cell Host Microbe. 2016; 20: 471-481
https://doi.org/10.1016/J.CHOM.2016.08.010
論文で見る
スコパス (0)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
安井理沙
鷲崎愛子
降旗康男
米崎貴史
大塚雄一郎
AbpAおよびAbpBは大腸菌において抗ファージ活性を示す。
Genes Genet. Syst. 2014; 89: 51-60
https://doi.org/10.1266/ggs.89.51
論文で見る
スコープス (5)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
サムソンJ.E.
マガダン A.H.
サブリ M.
モイノー S.
ファージの復讐：細菌の防御を破る。
Nat. Rev. Microbiol. 2013; 11: 675-687
https://doi.org/10.1038/nrmicro3096
論文で見る
スコープス (448)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Huiting E.
曹 X.
レン J.
Athukoralage J.S.
ルオ Z.
サイラス S.
アン N．
カリオン H．
Zhou Y.
フレイザー J.S.
ら
バクテリオファージは細菌のcGAS様免疫機能を阻害し、回避する。
Cell. 2023; 186: 864-876
https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.041
論文で見る
スコパス (10)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ペナー M.
モラド I.
スナイダーL.
カウフマンG.
ファージT4コード化Stp：DNAとtRNAの結合制限系の両刃のエフェクター。
J. Mol. Biol： 857-868
https://doi.org/10.1006/jmbi.1995.0343
論文で見る
スコープス (55)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ユー Y.T.
スナイダー L.
ファージ排除系で切断された翻訳伸長因子Tu。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994; 91: 802-806
https://doi.org/10.1073/pnas.91.2.802
論文で見る
スコープス (58)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ビンガム R．
エクンウェS.I.N.
フォーク S.
スナイダー L.
Kleanthous C.
バクテリオファージT4の主要頭部タンパク質は伸長因子Tuに特異的に結合する。
J. Biol. Chem. 2000; 275: 23219-23226
https://doi.org/10.1074/jbc.M002546200
論文で見る
スコープス (34)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
チャンプネス W.C.
スナイダー L.
ゴル部位：すべてのT4後期遺伝子の発現に影響を与えるシス作用性バクテリオファージT4制御領域。
J. Mol. Biol： 395-407
https://doi.org/10.1016/0022-2836(82)90478-8
論文で見る
スコープス (14)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ホッブス S.J.
ヴァインT.
ルー A.
モアハウスB.R.
シュナーベル J.
リービット A．
イールミヤ E．
ソレク R．
クランズシュ P.J.
ファージ抗CBASSおよび抗Pycsarヌクレアーゼは細菌免疫を破壊する。
Nature. 2022; 605: 522-526
https://doi.org/10.1038/s41586-022-04716-y
論文で見る
スコパス(21)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
テッソン F．
エルヴェ A.
モルドレ E.
トゥション M.
デュミエール C.
キュリー J.
ベルンハイム A.
原核生物の抗ウイルス兵器に関する系統的かつ定量的な見解。
Nat. Commun. 2022; 13: 2561
https://doi.org/10.1038/S41467-022-30269-9
論文で見る
スコープス (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ベルンハイムA.
ソレックR.
細菌の汎免疫システム：共同体資源としての抗ウイルス防御。
Nat. Rev. Microbiol. 2020; 18: 113-119
https://doi.org/10.1038/s41579-019-0278-2
論文で見る
スコープス(200)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キム・Y.T.
リチャードソン C.C.
バクテリオファージT7遺伝子2.5タンパク質：DNA複製に必須なタンパク質。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1993; 90: 10173-10177
https://doi.org/10.1073/pnas.90.21.10173
論文で見る
スコープス (60)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ホリス T.
スタッテルJ.M.
ワルサーD.S.
リチャードソン C.C.
エレンバーガー T.
バクテリオファージT7がコードする一本鎖DNA結合タンパク質、遺伝子2.5タンパク質の構造。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001; 98: 9557-9562
https://doi.org/10.1073/pnas.171317698
論文で見る
スコープス (83)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デイヴィソン J.
バクテリオファージT5とその近縁種の初期機能。
Bacteriophage. 2015; 5: e1086500
https://doi.org/10.1080/21597081.2015.1086500
論文で見る
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
クリムク E.
メクラーV.
ラヴィッシュD.
セレブリャコワ M.
アクレンコ N.
セヴェリノフ K.
バクテリオファージT5がコードする新規大腸菌RNAポリメラーゼ結合タンパク質。
Viruses. 2020; 12: 807
https://doi.org/10.3390/v12080807
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ロパティナ A.
タル N.
ソレックR.
頓挫感染：抗ウイルス免疫戦略としての細菌の自殺。
Annu. Rev. Virol. 2020; 7: 371-384
https://doi.org/10.1146/annurev-virology-011620-040628
論文で見る
スコープス (129)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ギュンターU.
ライナーズ L.
枯草菌ファージSPRは三重配列特異性を持つDNAメチルトランスフェラーゼをコードする。
核酸研究 1987; 15: 3689-3702
https://doi.org/10.1093/nar/15.9.3689
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マシュニッカM.A.
カミンスカ K.H.
ドゥニン-Horkawicz S。
Bujnicki J.M.
IV型制限酵素GmrSDファミリーの系統学と配列-構造-機能相関。
BMC Bioinformatics. 2015; 16: 336
https://doi.org/10.1186/s12859-015-0773-z
論文で見る
スコープス (15)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Xiong X.
ウー G.
Wei Y.
Liu L.
Zhang Y.
Su R.
Jiang X.
Li M.
Gao H.
Tian X.
他。
SspABCD-SspEは幅広い抗ファージ活性を持つホスホロチオエーション感知細菌防御システムである。
Nat. Microbiol. 2020; 5: 917-928
https://doi.org/10.1038/s41564-020-0700-6
論文で見る
スコープス (55)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
Liang J.
Wang Z.
He X.
Li J.
Zhou X.
Deng Z.
硫黄によるDNA修飾：修飾部位を取り巻く配列認識特異性の解析。
核酸研究 2007; 35: 2944-2954
https://doi.org/10.1093/NAR/GKM176
論文で見る
硫黄によるDNA修飾：修飾部位周辺の配列認識特異性の解析
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ブシャールJ.D.
Moineau S.
AbiKに対する感受性に関与する乳酸球菌ファージ遺伝子と一本鎖アニーリングタンパク質との関係。
J. Bacteriol. 2004; 186: 3649-3652
https://doi.org/10.1128/JB.186.11.3649-3652.2004
論文で見る
スコープス (46)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ワン C．
ヴィリオン M.
センパー C.
コロス C.
モイノー S.
ジンメリー S.
逆転写酵素関連タンパク質がファージ耐性を媒介し、in vitroで未鋳型DNAを重合する。
核酸研究 2011; 39: 7620-7629
https://doi.org/10.1093/NAR/GKR397
論文で見る
(0件)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
サムソンJ.E.
ベランジェM.
Moineau S.
ラクトコッカス・ラクティス・ファージの溶菌サイクルに及ぼす頓挫感染機構とIII型毒素／抗毒素系AbiQの影響。
J. Bacteriol. 2013; 195: 3947-3956
https://doi.org/10.1128/JB.00296-13
論文で見る
スコープス (37)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ルルー M.
スリカント S.
テオドロG.I.C.
チャン T.
リトルヘイル M.L.
ドロン S．
バディ・M.
レオン A.K.L.
ソレック R.
ラウブ M.T.
ウイルスDNAをADPリボシル化することによりファージ防御を行うDarTG毒素-抗毒素系。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 1028-1040
https://doi.org/10.1038/s41564-022-01153-5
論文で見る
スコープス (30)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
モシグ G．
Yu S.
Myung H.
ハッゴー＝リュングクイスト E.
ダベンポートL.
カールソン K.
カレンダー R.
ウイルス-ウイルス相互作用の新しいメカニズム：ファージP2スズタンパク質は、T4一本鎖DNA結合タンパク質GP32を被毒することにより、ファージT4のDNA合成を阻害する。
Virology. 1997; 230: 72-81
https://doi.org/10.1006/VIRO.1997.8464
論文で見る
スコープス (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
エルナンデス A.J.
リチャードソン C.C.
多機能バクテリオファージT7一本鎖DNA結合タンパク質Gp2.5
Semin. Cell Dev. Biol. 2019; 86: 92-101
https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2018.03.018
論文で見る
スコープス (20)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ベルナド A．
ブランコL.
ラサロJ.
マーティンG.
サラス M.
原核生物と真核生物のDNAポリメラーゼにおける保存された3′→5′エキソヌクレアーゼ活性部位。
Cell. 1989; 59: 219-228
論文で見る
筑波大学
PubMed
要旨
全文PDF
グーグル奨学生
カムテカー S.
バーマンA.J.
Wang J.
ラサロ・J.M.
デ・ベガ M.
ブランコ L.
サラス M.
Steitz T.A.
バクテリオファージφ29のタンパク質プライムDNAポリメラーゼの結晶構造から、鎖置換とプロセッシビティーに関する知見を得た。
Molecular Cell. 2004; 16: 609-618
論文で見る
筑波大学
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
スナイダー L.
ファージ排除酵素：生化学・細胞生物学試薬の大当たり？
Mol. Mol. Microbiol. 1995; 15: 415-420
https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.1995.tb02255.x
論文で見る
スコープス (140)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キメルマンA.
レヴィ A.
スベロH.
キドロンS.
リービットA.
アミタイG.
ヨーダー＝ハイムスD.R.
ウルツェルO.
朱 Y．
ルービン E.M.
他
細菌に毒性を示す微生物遺伝子の膨大なコレクション。
ゲノム研究 2012; 22: 802-809
https://doi.org/10.1101/GR.133850.111
論文で見る
(0件)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
モルティエ・バリエールI.
ヴェルテンM.
デュペーニュP.
Mirouze N.
ピエトルマンO.
マクガバン S.
フィシャン G.
マルタン B.
ノワロ P.
ル・カムE.
他
広範に存在する細菌タンパク質の形質転換における重要なシナプス前の役割： DprAはRecAにssDNAを伝達する。
Cell. 2007; 130: 824-836
https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.07.038
論文で見る
(169件)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
モリニューI.J.
シュミット C.K.
コンドレイ J.P.
F制限を逃れるバクテリオファージT7の変異体。
J. Mol. Biol. 1989; 207: 563-574
https://doi.org/10.1016/0022-2836(89)90465-8
論文で見る
スコープス (24)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チャン T．
タマン H.
コピータス・ワラントK.
倉田忠彦
ルルー M.
スリカント S.
ブロディアジェンコ T.
セパウスカス A.
タラベラ A.
マルテンスC.
他。
ウイルスカプシドタンパク質による細菌自然免疫系の直接活性化。
Nature. 2022; 612: 132-140
https://doi.org/10.1038/s41586-022-05444-z
記事で見る
スコパス(21)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ガオ L.A.
ウィルキンソン M.E.
Strecker J.
マカロワ K.S.
マクレー R.K.
クーニン E.V.
Zhang F.
保存されたウイルスタンパク質のパターン認識による原核生物自然免疫。
Science. 2022; 377: eabm4096
https://doi.org/10.1126/science.abm4096
論文で見る
スコパス (35)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Myung H.
カレンダーR.
バクテリオファージP2の古いエキソヌクレアーゼ。
J. Bacteriol. 1995; 177: 497-501
https://doi.org/10.1128/JB.177.3.497-501.1995
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リンダルG.
シローニG.
バイアリーH.
カレンダーR.
バクテリオファージ・ラムダ；ファージP2に対する溶原性細菌の頓挫感染。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1970; 66: 587-594
https://doi.org/10.1073/PNAS.66.3.587
論文で見る
パブコメ
クロスフィルム
グーグル奨学生
ゲグラーC.K.
ラウブ M.T.
宿主の転写停止が毒素-抗毒素系を誘発し、ファージRNAを切断して感染を停止させる。
Mol. Cell. 2021; 81: 2361-2373.e9
https://doi.org/10.1016/J.MOLCEL.2021.03.027
論文で見る
日本学術振興会特別研究員 (0)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
エドワーズ R.A.
ローワー F.
ウイルスメタゲノミクス
Nat. Rev. Microbiol. 2005; 3: 504-510
https://doi.org/10.1038/nrmicro1163
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ブロワー T.R.
エバンスT.J.
プラジビルスキーR.
フィネラン P.C.
サルモンド G.P.C.
RNAベースの分子模倣による細菌自殺システムのウイルス回避は、感染性利他主義を可能にする。
PLoS Genet. 2012; 8: e1003023
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003023
論文で見る
スコープス (78)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デュプイ M.È.
ヴィリオン M.
マガダン A.H.
モワノー S.
CRISPR-Casと制限修飾システムは互換性があり、ファージ耐性を高める。
Nat. Commun. 2013; 4: 2087
https://doi.org/10.1038/NCOMMS3087
論文で見る
スコープス (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
シラス S.
ルーカス-エリオP.
ジャクソン S.A.
アロカ-クレヴィレンA.
ハンセン L.L.
フィネラン P.C.
ファイア A.Z.
サンチェス-アマットA.
III型CRISPR-Casシステムは、I型システムからのウイルス脱出に対抗する冗長性を提供できる。
eLife. 2017; 6: e27601
https://doi.org/10.7554/eLife.27601
論文で見る
スコープス (54)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Maguin P.
ヴァーブルA.
モーデルJ.W.
マラフィニ L.A.
制限エンドヌクレアーゼによるウイルスDNAの切断は、II型CRISPR-Cas免疫応答を刺激する。
Mol. Cell. 2022; 82: 907-919.e7
https://doi.org/10.1016/j.molcel.2022.01.012
論文で見る
スコープス (12)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
馬場俊彦
荒剛
長谷川雅彦
高井康之
奥村康弘
馬場真理子
ダツェンコ K.A.
冨田昌宏
ワナー B.L.
森博之
大腸菌K-12インフレーム単一遺伝子ノックアウト変異体の構築：慶應コレクション。
Mol. Syst. 生物学 2006; 2: 2006.0008
https://doi.org/10.1038/MSB4100050
論文で見る
(0件)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ツィンマーマン L.
ステファンズA.
ナム S.Z.
ラウ D.
キューブラーJ.
ロザイッチ M.
ガブラー F.
セーディング J.
ルパス A.N.
Alva V.
新しいHHpredサーバーを中核とした、完全に再実装されたMPIバイオインフォマティクスツールキット。
J. Mol. Biol. 2018; 430: 2237-2243
https://doi.org/10.1016/j.jmb.2017.12.007
論文で見る
スコープス (1257)
PubMed
Crossref
グーグル奨学生
ジャンパーJ.
エヴァンスR.
プリッツェルA.
グリーン・T.
フィガーノフ M.
ロンネバーガー O．
トゥニャスヴナクールK.
ベイツ R.
ジーデク A.
ポタペンコA.
他
AlphaFoldによる高精度タンパク質構造予測。
Nature. 2021; 596: 583-589
https://doi.org/10.1038/s41586-021-03819-2
記事で見る
論文リスト(8095)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ミルディタ M.
シュッツェ K.
森脇祐子
Heo L.
オヴチニコフ S.
Steinegger M.
ColabFold: タンパク質のフォールディングを誰でも利用できるようにする。
Nat. Methods. 2022; 19: 679-682
https://doi.org/10.1038/s41592-022-01488-1
論文で見る
スコープス (937)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
クリシネルE.
ヘンリック K.
二次構造マッチング(SSM)、3次元での高速タンパク質構造アライメントのための新しいツール。
Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr.
https://doi.org/10.1107/S0907444904026460
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ディートヘレージD.E.
バリック J.E.
Breseqを用いた次世代シーケンスデータからの実験室内で進化させた微生物における変異の同定。
Methods Mol. Biol.
https://doi.org/10.1007/978-1-4939-0554-6_12
論文で見る
論文リスト(691)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シュレーディンガーL.
生理学MOL分子グラフィックスシステム。
(バージョン1.8)2015
http://www.pymol.org
論文で見る
グーグル・スカラー
ジョンソン M.
ザレツカヤ I.
レイセリス Y.
メレジュク Y.
マクギニス S.
Madden T.L.
NCBI BLAST: より優れたウェブインターフェース。
Nucleic Acids Res.
https://doi.org/10.1093/nar/gkn201
論文で見る
Scopus（2388件）
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ウィルソンG.A.
ボット K.F.
枯草菌形質転換系におけるコンピテンスの発現に影響する栄養因子.
J. Bacteriol. 1968; 95: 1439-1449
https://doi.org/10.1128/jb.95.4.1439-1449.1968
論文で見る
スコープス (130)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チョン C.T.
ミラーR.H.
コンピテント大腸菌細胞の調製と保存。
Methods Enzymol. 1993; 218: 621-627
https://doi.org/10.1016/0076-6879(93)18045-E
論文で見る
スコープス (58)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
クロピンスキー A.M.
マッツォッコA.
ワッデル T.E.
リンゴールE.
ジョンソン R.P.
二重寒天オーバーレイプラークアッセイによるバクテリオファージの定量。
in： Clokie M.R.J. Kropinski A.M. Bacteriophages： Methods and Protocols. Humana Press, 2009： 69-76
https://doi.org/10.1007/978-1-60327-164-6_7
論文で見る
スコープス (514)
クロスリファレンス
グーグル・スカラー
マッツォッコ A.
ワッデル T.E.
リンゴールE.
ジョンソン R.P.
小滴プラークアッセイシステムを用いたバクテリオファージの定量。
in： Clokie M.R.J. Kropinski A.M. Bacteriophages： Methods and Protocols. Humana Press, 2009： 81-85
https://doi.org/10.1007/978-1-60327-164-6_9
記事で見る
スコープス (108)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ベイム M.
クリャジムスキーS.
リーバーマンT.D.
チョン H.
デサイ M.M.
Kishony R.K.
メガベースサイズのゲノムに対する安価な多重ライブラリー調製法。
PLoS One. 2015; 10: e0128036
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0128036
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ドゥブリエ S.
タボールS.
ロング A.M.
リチャードソン C.C.
エレンバーガー T.
バクテリオファージT7 DNA複製複合体の2.2Å分解能結晶構造。
Nature. 1998; 391: 251-258
https://doi.org/10.1038/34593
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チェン I.-M.A.
チュー K.
パラニアッパンK.
ラトナー A.
ホアン J.
ハンテマン M.
ハジェク P.
リッター S.
ヴァルゲーゼ N.
セシャドリ R．
他。
IMG/Mデータ管理・解析システムv.6.0：新しいツールと高度な機能。
Nucleic Acids Res. 2021; 49: D751-D763
https://doi.org/10.1093/nar/gkaa939
論文で見る
スコープス(210)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
アンドラオス N.
タボールS.
リチャードソン C.C.
バクテリオファージT5の高プロセッシブDNAポリメラーゼ：ユニークなN末端とC末端の役割。
J. Biol. Chem. 2004; 279: 50609-50618
https://doi.org/10.1074/jbc.M408428200
論文で見る
スコープス (22)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
論文情報
出版履歴
発行 2023年4月7日
受理受理：2023年2月20日
改訂版受理 2023年1月9日
受理：2023年1月9日 2022年8月12日
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.02.029

このサイトのコンテンツは、あらゆる科学分野の医療従事者や研究者を対象としています。

研究ジャーナル
細胞
癌細胞
細胞化学生物学
細胞ゲノム
細胞宿主と微生物
細胞代謝
細胞レポート
セルレポーツ医学
セルレポーツ・メソッド
セルレポート物理科学
セルレポートサステイナビリティ
細胞幹細胞
細胞システム
化学
化学触媒
カレントバイオロジー
発生細胞
デバイス
ヘリオン
免疫
アイサイエンス
ジュール
マター
医学
分子細胞
ニューロン
一つの地球
パターン
STARプロトコル
構造
トレンドレビュージャーナル
生化学
バイオテクノロジー
癌
細胞生物学
化学
認知科学
生態学・進化学
内分泌学・代謝学
遺伝学
免疫学
微生物学
分子医学
神経科学
寄生虫学
薬理学
植物科学
パートナージャーナル
AJHG
生物物理ジャーナル
生物物理学レポート
HGGアドバンス
分子植物
分子治療ファミリー
ネクサス
植物通信
幹細胞レポート
イノベーション
コレクション
ベスト・オブ・セルプレス
セルプレスレビュー
セルプレスセレクション
コンソーシアムハブ
Nucleusコレクション
スナップショット・アーカイブ
ジャーナルを超えて
細胞キャリアネットワーク
細胞シンポジウム
ラボリンク
ウェビナー
論文を進化させる
コミュニティ・レビュー
図360
スニークピーク
STARメソッド
社会における科学
セル・ピクチャー・ショー
セルプレスポッドキャスト
セルプレスビデオ
ぬりえ＆コミック
リサーチ・アーク
コネクト
セルプレスについて
採用情報
お問い合わせ
ヘルプ＆サポート
ニュースルーム
出版アラート
アクセス
購読申し込み
今すぐ読む
司書に薦める
インフォメーション
広告主の皆様へ
リクルーターの方へ
図書館員の方へ
利用規約
プライバシーポリシー
アクセシビリティ

当サイトでは、サービスの提供・向上およびコンテンツのカスタマイズのためにクッキーを使用しています。クッキーの設定を更新するには、このサイトのクッキー設定をご覧ください。
著作権 © 2023 Elsevier Inc. 第三者により提供された一部のコンテンツを除く。

RELX

この記事が気に入ったらサポートをしてみませんか？