諸刃の剣：糞便マイクロバイオーム移植が腸内レジストームに与える影響

諸刃の剣：糞便マイクロバイオーム移植が腸内レジストームに与える影響

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36504032/

Haley Anne Hallowell et al. Curr Opin Gastroenterol. 2023.
詳細を見る

引用元

概要
レビューの目的 糞便マイクロバイオーム移植（FMT）は、クロストリジオイデスディフィシル感染症などの様々な疾患の治療において有望視されている。また、FMTは腸内のレジストームと呼ばれる抗生物質耐性遺伝子（ARG）の集合体を調節する能力があることも実証されている。このレビューの目的は、FMTと腸内レジストームの相互作用に関する文献を批判的に評価し、FMTが腸内のARGキャリッジを減らすために特別に使用できるかどうかを判断することであった。

最近の知見 いくつかの研究では、C. difficile感染症の再発や抗生物質使用後など、さまざまな病状においてFMT投与後にARGキャリッジが減少することが実証されています。しかし、他の研究では、FMT後のレジストームの拡大が報告されています。ほとんどの研究では、結果にかかわらず患者コホートが小さく、反応に不均質性が見られました。

まとめ FMTによるレジストーム調節に関する研究は予備的なものであり、ヒトでの研究は現在、利点とリスクに関するコンセンサスを欠いている。安全性の観点から、抗生物質耐性菌に加えてARGについてもドナーサンプルをスクリーニングすることが望ましいと思われる。FMTをレジストーム改善のための効率的なアプローチと考える前に、研究および個人間の不均質性の基礎となるメカニズムに関するさらなる研究が必要である。

著作権 © 2022 Wolters Kluwer Health, Inc. All rights reserved.

参考文献
Malard F, Dore J, Gaugler B, Mohty M. Introduction to host microbiome symbiosis in health and disease（健康と疾患における宿主マイクロバイオーム共生の概説）。Mucosal Immunol 2021; 14:547-554.
Lynch SV, Pedersen O. The human intestinal microbiome in health and disease（健康と疾患におけるヒト腸内細菌群）. N Engl J Med 2016; 375:2369-2379。
Ooijevaar RE, Terveer EM, Verspaget HW, et al. 糞便Microbiota移植の臨床的応用と可能性. Annu Rev Med 2019; 70:335-351.
Zhang Z, Mocanu V, Cai C, et al. 便中Microbiota移植の肥満とメタボリック症候群への影響-システマティックレビュー. ニュートリエンツ 2019; 11:2291.
Xu D, Chen VL, Steiner CA, et al. 過敏性腸症候群における糞便マイクロバイオータ移植の有効性：系統的レビューとメタ分析。Am J Gastroenterol 2019; 114:1043-1050.
DeFilipp Z, Bloom PP, Torres Soto M, et al. 糞便微生物腔移植により感染した薬剤耐性大腸菌血症。N Engl J Med 2019; 381:2043-2050.
Wang S, Xu M, Wang W, et al.系統的レビュー：糞便微生物腔移植の有害事象。PLoS One 2016; 11:e0161174.
Steed DB, Wang T, Raheja D, et al. 再発性Clostridioides difficile感染に対するFecal Microbiota transplantation後のグラム陰性分類群と抗菌薬感受性. mSphere 2020; 5:e00853-20.。
Caballero S, Carter R, Ke X, et al. Distinct but spatially overlapping intestinal niches for vancomycin-resistant Enterococcus faecium and carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae. PLoS Pathog 2015; 11:e1005132.
Bar-Yoseph H, Carasso S, Shklar S, et al. メタゲノムの観点によるカルバペネマーゼ産生腸内細菌科コロニー根絶のための経口カプセル化糞便微生物叢移植法. Clin Infect Dis 2021; 73:e166-e175.
Hyun J, Lee SK, Cheon JH, et al. 便微生物移植は、多剤耐性菌患者における抗生物質耐性遺伝子の量を減らす。Antimicrob Resist Infect Control 2022; 11:20.
Li L, Wang Q, Gao Y, et al. Colistin and amoxicillin combinatorial exposure alterters the human intestinal microbiota and antibiotic resistome in the simulated human intestinal microbiota.コリスチンとアモキシシリンの組み合わせ暴露は、ヒト腸内細菌叢を変化させ、抗生物質レジストームを変化させる。Sci Total Environ 2021; 750:141415.
Bose D, Chatterjee S, Older E, et al. Gulf War chronic multisymptom illnessにおけるホスト腸内レジストームは、持続的な炎症と相関している。Commun Biol 2022; 5:552.
Kang K, Imamovic L, Misiakou M-A, et al. 抗生物質治療後の抗生物質特異的耐性遺伝子の拡大および持続性。Gut Microbes 2021; 13:1-19.
Bajaj JS, Shamsaddini A, Fagan A, et al. 肝硬変における糞便微生物移植は腸内細菌の抗生物質耐性遺伝子を減らす：2つの試験の分析. Hepatol Commun 2021; 5:258-271。
Fernández J, Prado V, Trebicka J, et al. European Foundation for the Study of Chronic Liver Failure (EF-Clif)。欧州の減圧性肝硬変患者および急性on慢性肝不全患者における多剤耐性菌感染症。J Hepatol 2019; 70:398-411.
Millan B, Park H, Hotte N, et al. 糞便微生物移植は、再発性クロストリジウム・ディフィシル感染症患者における抗生物質耐性遺伝子を減少させる。Clin Infect Dis 2016; 62:1479-1486.
Buelow E, Bello González Tdj, Fuentes S, et al. 選択的消化管除染を受けた集中治療患者と健常者の腸内細菌叢およびレジストームプロファイリングの比較。マイクロバイオーム 2017; 5:88.
Feng J, Li B, Jiang X, et al. メタゲノム解析およびネットワーク解析によって解読された大規模な健康なヒト腸内細菌叢における抗生物質レジストーム。エンバイロン・マイクロバイオロジー 2018; 20:355-368.
Jouhten H、Mattila E、Arkkila P、Satokari R. 糞便Microbiota移植後の再発性Clostridium difficile感染症患者の腸内Microbiotaにおける抗生物質耐性遺伝子の減少. Clin Infect Dis 2016; 63:710-711.
Montassier E, Valdés-Mas R, Batard E, et al. Probiotics impact the antibiotic resistance gene reservoir along the human GI tract in a person-specific and antibiotic-dependent manner.プロバイオティクスは、ヒトGI管に沿った抗生物質耐性遺伝子リザーバーに影響を与える。Nature Microbiology 2021; 6:1043-1054.
Zellmer C, Sater MRA, Huntley MH, et al. 糞便微生物叢移植による志賀毒素産生性大腸菌の伝播. Clin Infect Dis 2021; 72:e876-e880.
Leung V, Vincent C, Edens TJ, et al. 再発性クロストリジウム・ディフィシル感染症に対する糞便マイクロバイオータ移植後の抗菌薬耐性遺伝子獲得と枯渇. Clin Infect Dis 2018; 66:456-457.
Liu H, Wang HH. Microbiota移植がgnotobioticブタとヒト被験者の腸内Microbiotaのレジストームに与える影響。Front Microbiol 2020; 11:932.
Zhang A-N, Gaston JM, Dai CL, et al. 抗菌剤耐性遺伝子の健康リスクを評価するためのオミックスベースのフレームワーク. Nat Commun 2021; 12:4765.
Crits-Christoph A, Hallowell HA, Koutouvalis K, Suez J.良い微生物、悪い遺伝子？ヒトマイクロバイオームにおける抗菌薬耐性の普及。Gut Microbes 2022; 14:2055944.
品質と安全性 - OpenBiome. https://www.openbiome.org/safety#:∼:text=The OpenBiome Quality %26... で利用可能。[2022年6月29日アクセス］。
Vendrik KEW, Terveer EM, Kuijper EJ, et al. Netherlands Donor Faeces Bank Study Group（オランダ・ドナー糞便バンク研究会）. 糞便微生物移植時の多剤耐性菌の伝播防止のための検疫期間を設けたドナー糞便の定期的なスクリーニング：レトロスペクティブコホート研究. Lancet Infect Dis 2021; 21:711-721.
Suez J, Zmora N, Segal E, Elinav E. The pros, cons, and many unknowns of probiotics.プロバイオティクスの長所、短所、多くの未知数。ナットメッド2019; 25:716-729.
Langdon A, Schwartz DJ, Bulow C, et al. CDC Prevention Epicenter Program（CDC予防エピセンタープログラム）。微生物叢の修復は、オープンラベルのPUNCH CD試験から、再発性クロストリジオイデスディフィシル感染症の患者における抗生物質耐性菌の腸内コロニー形成を減少させる。Genome Med 2021; 13:28.
Kwak S, Choi J, Hink T, et al. CDC Prevention Epicenter Program（CDC予防エピセンタープログラム）。プラセボ対照臨床試験で明らかになった、治験用マイクロバイオータ治療薬RBX2660の腸内マイクロバイオームとレジストームへの影響。Microbiome 2020; 8:125.