細菌病原体と常在菌に関する研究を統合して感染症と闘う-生態学的観点から

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細菌病原体と常在菌に関する研究を統合して感染症と闘う-生態学的観点から
リサ・マイヤー博士
クリストフ・シュタイン・テリンガー医学博士
ルース・E・レイ博士
ハイケ・ブレッツ-オスターヘルト博士
ハネス・リンク博士
ナディーネ・ツィーマート博士
他
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オープンアクセス掲載:2024年04月09日DOI:https://doi.org/10.1016/S2666-5247(24)00049-1

概要
抗生物質耐性菌感染症は増加の一途をたどっており、製薬業界は新しい抗生物質の開発を優先していない。細菌の適性、競争、伝播の生態学的原則に基づく学際的研究アプローチは、抗生物質耐性感染症に対抗する新たな道を開く可能性がある。多くの通性細菌病原体は、ヒトの粘膜表面を主要なリザーバーとして利用し、マイクロバイオームと宿主のある種の病的状態下で、新たな宿主生物への横方向の感染を助けるために感染症を誘発する。有益な常在細菌は特定の病原体を凌駕し、それによって病原体の拡散能力を低下させ、重篤な感染症を引き起こす。しかし、臨床的意義があるにもかかわらず、常在細菌と病原体の自然な生息環境における相互作用についての理解はまだ不十分である。このPersonal Viewでは、ヒトのマイクロバイオームと宿主生物学との関連において、細菌性病原体と常在菌との相互作用に関する研究を強化し、感染症を予防・治療する革新的かつ持続可能な方法の開発につなげるための方向性を明らかにする。
はじめに
ヒトマイクロバイオームの完全性が健康上の必要条件であるとの認識が高まるにつれ、細菌マイクロバイオームメンバーとその相互作用（細菌間および宿主との相互作用）に対する評価が大きく変わりつつある。このような理解の変化により、微生物生態学の原理は、ヒトの主要疾患の予防と治療のための革新的なアプローチの中心に据えられている。メタゲノム解析から推測されるマイクロバイオームのシグネチャーは、大腸がんや乳がんなどのさまざまな種類のがんから、関節リウマチや乾癬などの自己免疫疾患まで、さまざまな疾患の診断におけるバイオマーカーとして検討されている。糞便微生物叢の移植は、クロストリジオイデス・ディフィシル感染症の治療に効果的に用いられており、マイクロバイオームのメンバー（例えば、アッカーマンシア・ムチニフィラ）やマイクロバイオーム産物（例えば、短鎖脂肪酸）の補充は、代謝性疾患とがんの両方における健康転帰の改善に有望であることが示されている1,2。しかし、環境微生物生態系とヒト関連微生物生態系には基本的な違いが存在する3。多くの環境微生物群は、広大で制限のない生態系を形成しており、微生物の拡散に対して最小限の障壁となる無制限の寿命を持つことが多い。対照的に、ヒト腸内のような宿主関連マイクロバイオームは、寿命が短く制限された生態系である。さらに宿主は、特に粘膜免疫系を介して、微生物のコロニーを生息環境以外のストレス要因に曝す5。
歴史的に、宿主に関連する微生物の生態系に関する研究は、中立的あるいは相互依存的な常在細菌と有害な病原体に関する、異なる研究グループによる個別の研究に限られてきた。その結果、これらの異なる宿主関連細菌群に関する現在の理解は、病原菌に強く偏った非対称的なものとなっており、ヒトのマイクロバイオーム生態系に関する包括的な理解を妨げている。例えば、典型的な病原体はヒトのマイクロバイオームにおいて事実上家畜化されたメンバーとして存在するのに対し、常在細菌は多細菌感染症のように病原体と共謀することがある。
従来の常在微生物と病原性微生物の区別は、感染症医療において重要な基準であり続けているが、生態学的な観点から見ると、これらの微生物群の性質には固有の重複があるため、この区別は不適切である7。有益な常在性と拮抗的な病原性は、細菌の行動範囲の対極を表しているが（図1）、実際の病原性行動を示す細菌マイクロバイオームメンバーは少ない。多くの細菌種や細菌クローンは、環境的背景や宿主の生理学的状態によって、常在菌や病原体として機能する能力を動的に変化させることができ、これがさらに区別を複雑にしている（図1）。例えば、マイクロバイオーム異常症と宿主の免疫異常は、腸内細菌叢のほぼ無害なメンバーであったエンテロコッカス・フェシウムを、血流感染症の原因菌へと変化させる可能性がある8。さらに、プロファージにコードされた毒素が腸管出血性大腸菌の主要な病原因子となったり、皮膚や口腔咽頭を絨毛化するコリネバクテリウム・ジフテリアの主要な病原因子となったりするように、たった一度の遺伝子の水平移動が、常在性と病原性のバランスを変えることもある9。
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図1常在細菌と病原性細菌の行動の連続性
キャプション
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通性細菌病原体における常在性と病原性の間のダイナミックな変化は、現在の感染という用語の、しばしば一貫性のない使い方に疑問を投げかけている。我々は、特定の臓器組織における細菌株の出現によって引き起こされる病的状態に対して、感染という用語を保留することを提案する。このような病態には、例えば、食物や水を媒介とする大腸のシゲラ・フレクスネリによる下痢、皮膚の黄色ブドウ球菌による膿瘍、肺の肺炎球菌による肺炎などが含まれる。従って、この個人的見解では、定期的に感染症を引き起こす細菌を病原体、そうでないものを常在菌と呼ぶが、この用語には限界があり、すべてのタイプの微生物-宿主拮抗作用を適切に表現しているわけではないことは認める。病原体と常在菌の曖昧な区別は、特定の微生物と対応する疾患との間に一義的な関係があることを示唆するコッホの定説にも疑問を投げかけている1。しかし実際には、複数の細菌種の間接的な影響から生じる疾患もあり、そのような細菌種の単なる存在ではなく、マイクロバイオームのアンバランスが、典型的な感染症とはみなされない特定の病的状態を引き起こす場合もある7。
マイクロバイオーム科学の急速な進歩は、新たな技術とともに、還元主義的アプローチを超えて、病原細菌と常在細菌の研究を統合する微生物学の新たな段階を設定した10。環境コンテクストの変化が、細菌マイクロバイオームメンバーの動的な行動変化にどのように影響するかを調べるためには、多様な背景を持つ微生物学者が協力し、システム生物学、天然物化学、粘膜免疫学、臨床感染症などの補完的な分野の専門知識を組み合わせる必要がある。このような新たなアプローチは、最も関連性の高い明白な疑問のいくつかに答える助けとなるかもしれない： なぜ少数の宿主関連細菌だけが、その遺伝情報のかなりの部分を宿主細胞を操作し、害を与えることに費やすのか？そのようなプロの病原体が病原性因子を発現する生態学的特典は何なのか？微生物叢の構成が乱れたり、宿主の免疫防御機能が低下したりすると、なぜ一部の常在菌が病気を引き起こす偶発的病原体に変わるのだろうか（表1）。感染症、特に抗生物質耐性病原体や治療困難な病原体による感染症の効果的な予防法や治療法を開発するために、生態学的原理に関する現在の知識をどのように活用できるのか？マイクロバイオームを最適化することで、健康を促進するプロバイオティクス細菌を育んだり、病原体を特異的に不活性化したりすることができる一方で、常在菌は無傷でいられるようにすることができるのだろうか（表2）25。以下のセクションでは、常在菌と病原性細菌の生存メカニズムに取り組む研究の方向性について述べる。
表1 ヒトに適応した業務用または偶発的病原体の例
ヒトへの感染、ヒト集団における流行 代表的な感染経路 感染を促進する代表的な感染症 感染を促進しない代表的な感染症
職業的病原体
Shigella flexneri11 大腸、通常一過性の保菌 下痢症 関節炎
黄色ブドウ球菌12 鼻腔、20～30％、一過性の保菌が多い 皮膚-皮膚化膿性皮膚膿瘍、膿痂疹、創傷感染 深部膿瘍、血流感染症
淋菌13 泌尿器；通常一過性保菌 性的接触、皮膚-皮膚 尿道炎--。
咽頭炎、膿痂疹 猩紅熱、リウマチ熱、血流感染 肺炎球菌
咽頭炎、膿痂疹 猩紅熱、リウマチ熱、血流感染 肺炎球菌15 喉、小児では27～65％、成人では低い 経口-経口 気管支炎、肺炎、副鼻腔炎 血流感染、髄膜炎
百日咳菌16 喉、通常は一過性経口感染 百日咳.
偶発性病原体
腸球菌（Enterococcus faecium）8,17 大腸, 23-62% 糞便-経口 -- 血流感染
大腸菌18,19 (常在菌) 大腸, 61% 糞便-経口 -- 尿路感染、血流感染
ヘリコバクター・ピロリ20 胃, 世界人口の成人の43% 口腔-経口、糞便-経口 -- 胃潰瘍、胃がん
表皮ブドウ球菌21 皮膚、鼻咽頭、ほぼすべてのヒト 皮膚-皮膚 -- インプラント関連感染、血流感染
皮膚-皮膚 -- 逆性ざ瘡に関与すると考えられている。
Streptococcus sanguinis23 口腔、ほぼすべてのヒト 口腔内 -- 心内膜炎
髄膜炎（Neisseria meningitidis）24 鼻咽頭、5～24％ 口腔内 -- 髄膜炎
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表2細菌感染に対するマイクロバイオーム生態学的アプローチの展望
介入手段
治療法

ファージ療法や特異的な抗ウイルス薬、抗適性薬など、狭い範囲の抗感染症薬を開発し、重要な常在菌を温存し、マイクロバイオームの完全性を維持する。

常在細菌や病原性マイクロバイオームの耐性遺伝子の有無に基づいて、抗生物質を賢く選択する。
予防

重篤な微生物由来の感染症のリスクを軽減するために、病原体を排除する常在菌でリスクのある人をコロニー形成する。

多病患者に抗生物質以外の薬剤を併用すると、有益な常在菌が阻害され、感染症のリスクが高まる可能性があることを考慮する。

病原体を排除する粘膜ワクチンの開発
サーベイランス

特に、横方向への感染を促進する病原体のクローン系における病原性因子の流行と進化に注目する。

抗菌薬耐性を付与する移動性遺伝要素を持つ常在菌の進化と拡散を監視する。
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病原体の研究に触発された常在菌の今後の研究
S flexneri、S aureus、S pneumoniaeのような主要な細菌病原体は、その臨床的意義の高さと培養や操作が比較的容易であることから、数十年にわたり、典型的な宿主関連常在菌よりもはるかに大規模に研究されてきた。大腸菌の院内クローン、大腸菌フェシウム、表皮ブドウ球菌など、特定の状況下で偶発的に病原体となりうる常在菌の一部は、ある程度研究されているが、なぜこれらの特定の細菌が、他の無害な常在菌よりも頻繁に侵襲性感染症を引き起こすのかは、依然として不明である（表1）8,21,28。
例えば、Blautia productaの常在菌クローンは、特異的な抗菌性化合物を産生することで、E faeciumを抑制・排除し、Staphylococcus lugdunensisの常在菌クローンは、黄色ブドウ球菌を抑制・排除する30,31。常在菌の中には、宿主生物に直接有益な効果をもたらす化合物を産生するものもあり（図2）、例えば腫瘍治療の成功を促進する34,35。病原体に関する研究は、このような有益な常在菌の生物学を理解し、細菌感染に対して常在菌を利用するのに役立つ（表2）。常在菌の多くの重要な特性は、例えば耐性や適性をコードするゲノムアイランドなどの可動性遺伝要素の獲得や喪失によって、個々の菌株間で異なる可能性がある36。配列タイピングスキームなど、病原体のクローン特異的分類のための確立されたアプローチは、常在菌にも適用できる可能性がある。これらのアプローチは、特定の有害な病原体の存在だけでなく、潜在的な病原体によるコロニー形成を防御するような特定の有益な常在菌の不在もモニタリングすることで、現在の診断戦略を新たなレベルの個別化感染症医療へと強化するのに役立つであろう（表2）。
図サムネイルgr2
図2常在菌、病原体、宿主の複雑な相互作用
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宿主特異性をもたらす適応過程は、おそらく他のあまり適応していない微生物との競争において、細菌の体力を向上させる戦略として機能する。その基礎となるメカニズムは、病原体についてはほとんど解明されておらず、病原性のない常在菌についてはほとんど不明である38。特定の宿主に継続的にコロニーを形成するかどうかは、多くの場合、表面タンパク質、プロテオグリカン、糖脂質などの上皮結合モチーフへの効果的な接着に依存している39。
上皮表面での細菌の生存は、IgA、抗菌ペプチドや脂質、活性酸素や窒素化合物の産生を含む粘膜の宿主防御機構によって制限される5。粘膜白血球による微生物関連分子パターン分子の感知や微生物抗原の検出によって開始される自然免疫および適応免疫機構は、粘膜免疫のプロセスを補助し、炎症性または抗炎症性のシグナル伝達分子やエフェクター分子の放出をもたらす41。宿主の継続的なコロニー形成は、細菌が抗菌性免疫エフェクターに耐性を持つか、免疫寛容を誘導することでその発現を減少させることができるかどうかにかかっている。宿主の免疫反応に応じてマイクロバイオームの他のメンバーと拮抗的に干渉することは、表皮菌42や腸管サルモネラ菌43で報告されている。例えば、腸内常在菌の中には、ヒトToll様受容体5を不活性化する非炎症性のフラジェリンタンパク質や、粘膜表面で制御性T細胞を誘導する短鎖脂肪酸を産生することで、自然免疫応答を鈍らせ、免疫寛容を促進するものがある45。しかし、経口常在菌が異所的に腸内にコロニー形成された場合など、宿主が寛容を開始できず、炎症で反応するような状況では、根本的な制御メカニズムが乱され、疾患につながる可能性がある46。
全体として、宿主に関連した生態系における細菌の相互作用は、分泌因子に大きく依存している。分泌因子は、特殊な分泌システムを介して個々の可溶性分子として、あるいは膜小胞の構成成分として放出される（図2）。このような理由から、細菌病原体の分泌型病原性因子が集中的に研究されてきた。これとは対照的に、常在菌の分泌する一次代謝産物や二次代謝産物、あるいはタンパク質メディエーターが、病原体や宿主との相互作用をどのように調節しているのかについては、これまでほとんど研究されてこなかった47。
通性ヒト病原体の適性メカニズムに関する知識の拡大
多くの主要な細菌性ヒト病原体は、義務的病原体ではなく、一般的なマイクロバイオームのメンバーとしてヒトや動物の体表面にコロニーを形成しているが、病気を引き起こすことはない（表1）。しかし、これまでの研究では、S flexneri、S aureus、S pneumoniaeのような病原体の病原性メカニズムに焦点が当てられており、常在菌として生活する中で、他のマイクロバイオームメンバーとの競争の中で、これらの微生物のフィットネスを左右するメカニズムは、依然として無視されている51。微生物から見ると、どのようなタイプの感染が細菌にとって本当に有利なのか、あるいはむしろ、数世代にわたる宿主の長期的な進化の成功にとってメリットがない、偶発的な出来事とみなすべきなのか（図3）、依然として不明である。
図のサムネイルgr3
図3感染症は宿主から宿主へ、プロフェッショナルな細菌病原体をどのように拡散させるのか？
キャプション
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細菌感染症に関する現在の知識は、黄色ブドウ球菌12や肺炎桿菌15などの少数のモデル病原体に限られている。一方、有名な抗生物質耐性菌の中には、E faecium、S aureus、Klebsiella pneumoniae、Acinetobacter baumannii、Pseudomonas aeruginosa、Enterobacter cloacaeといった病原菌の属名の頭文字をとってESKAPE病原菌と名付けられたものもある53。抗生物質耐性機構は通常、抗生物質の選択圧がない場合の体力負担を表しているが、ESKAPE病原体の中には、医療環境外でも維持される耐性形質を進化させたものがある。このような市中感染型のメチシリン耐性黄色ブドウ球菌やバンコマイシン耐性E faeciumが、なぜ抗生物質感受性の兄弟菌を犠牲にして、これほど効果的に拡散・拡大するのかは、いまだ謎のままである55,56。
生態学的概念は、一般微生物学や環境微生物学の分野では一般的であるが、病原性細菌の理解にはあまり応用されていない。他のマイクロバイオームメンバーとの競争における細菌クローンの成功は、成長を制限する栄養素を利用する能力、他の細菌から高分子加水分解酵素や微量金属捕捉メタロフォアなどの成長を促進する共通財から利益を得る能力、微生物群集のメンバーが放出する抗菌性分子に耐える能力、少数の上皮付着部位に付着する能力など、さまざまなメカニズムに依存する6,51。細菌種またはクローンの長期的な生態学的成功は、特定の宿主生物内での種の増殖と、新たな宿主生物への種の拡散の複合効果によってもたらされる（図3）。特定の宿主生物内での種の増殖を調べるには、常在菌の研究から、主要な業務用病原体や偶発的病原体の調査まで、相互作用や拮抗作用に関するさまざまな研究戦略を採用する必要がある。新しい宿主生物への種の拡散を調査するためには、革新的な実験的アプローチを用いて、新しい宿主生物への伝播過程を探る必要がある。ヒトや動物の宿主にコロニーを形成したり感染したりする細菌は、新しい宿主生物への垂直伝播（親から子へ）と側方伝播（社会的相互作用を介して）という2つの異なる戦略を用いることができる。垂直伝播は微生物-宿主間の適応を促進し、一般的に常在菌が用いるのに対し、側方伝播は多くの病原体において一般的である。しかし、個々のマイクロバイオームの発達は両方の戦略に依存している可能性があり、2つの戦略は異なる細菌種の伝播に異なる貢献をしている。例えば、ヘリコバクター・ピロリ20、肺炎桿菌15、および黄色ブドウ球菌については、流行性病原体クローンの横方向への伝播パターンが詳細に研究されている。したがって、細菌マイクロバイオームの中には、主に垂直方向にゆっくりとしか拡散しないものと、ヒトの大規模集団においてさえも、個体から個体へと迅速に拡散するものがある理由は不明である。
主要な病原体の蔓延は、おそらくその病原体が引き起こす感染症の種類と重症度に関連している（表1、図3）。下痢を引き起こすS flexneriのように、汚染された下水を介して感染が拡大する場合、疾患の特徴が細菌の伝播に寄与することは明らかである11。黄色ブドウ球菌による典型的な感染症である化膿性皮膚感染症や創傷感染症では、体表面に大量の黄色ブドウ球菌が出現し、皮膚接触を介して宿主から宿主へ感染が拡大する12。重症度が病原体の伝播にどのように寄与するかについては、例えばSARS-CoV-2の文脈で議論されているが58、細菌性病原体については体系的に評価されていない。注目すべきは、ほとんどの細菌性病原体はヒトマイクロバイオームの中心メンバーではなく、一過性にしかヒトに定着しないことである（表1）。専門的なヒト病原体（例えば、S flexneriやN gonorrhoeae）による継続的なコロニー形成は稀であるか、あるいはヒト集団のごく一部（例えば、S aureus）や特定の年齢層（例えば、S pyogenesやS pneumoniae）にしか見られないことから、広範な病原性武装の維持には、他のマイクロバイオームメンバーとの競合による相当な適性負荷が伴うことが示唆される。
E faeciumやS epidermidisなどの偶発的病原体は、免疫回避能力を補助する因子を発現するが、攻撃的な毒素はほとんど発現しないため、ヒトのマイクロバイオームにおけるこれらの病原体の有病率や持続性は、ほとんどの専門的病原体よりも高い（表1）。しかし、この用語は黄色ブドウ球菌や肺炎桿菌のような職業的病原体にもよく使われる。これらの病原体は、免疫不全者では免疫不全者よりも重篤な感染症（典型的には血流感染症）を引き起こす。レジオネラ・ニューモフィラ（Legionella pneumophila）59やビブリオコレラ（Vibrio cholerae）60のように、ヒト以外の宿主に適応し、特定の環境条件下でのみヒトに感染する病原体が、ヒトへの偶発感染を引き起こすこともある。
常在細菌と病原体のフィットネスを統合的に理解することは、感染予防に役立つ。
常在菌と病原体を自然の文脈の中で一緒に調査することは、微生物を制御し、感染症やその他の微生物関連疾患と闘うより良い方法を特定するのに役立つ。常在細菌は、これまで考えられていたよりもはるかに複雑な影響を感染症に与えているようだ（図2）。常在菌の中には、抗菌性バクテリオシンの放出や、接触依存性のV型、VI型、VII型分泌系による他の細菌の排除など、能動的な防御戦略を用いる種もあり、これらは特定の標的種に対する特異性が大きく異なることがある。常在細菌群集は、肺炎桿菌（K pneumoniae）や腸管出血性大腸菌（S Typhimurium）などの病原体の栄養源へのアクセスを、その多様性と病原体との代謝的重複度に依存した協調的な方法で阻害することができる62。また、常在細菌が放出する金属胞63による必須微量金属の隔離や、阻害性代謝産物の産生によって、病原体の排除がもたらされることもある。例えば、腸内常在菌の中には、一次胆汁酸を二次胆汁酸代謝産物に変換し、腸内病原菌C difficileの芽胞の発育を阻害するものがある64。
糞便中マイクロバイオーム移植によるマイクロバイオームの回復は、C difficile感染症を治療するための効果的な戦略である。糞便中マイクロバイオーム移植の成功の少なくとも一因は、C difficileの増殖を抑制する有益な細菌群集とその代謝産物の回復によるものである。前臨床試験や臨床試験では現在、抗生物質耐性の病原体によるコロニー形成を予防するために、常在菌をベースとした生命治療製品の使用が評価されている（表2）25。しかし、病原体のコロニー形成を予防する常在菌は、標的となる病原体よりも抗生物質に対して感受性が高いことが多い65。重要な常在菌群の抗生物質感受性を系統的に評価し、そのような知識を個別化されたマイクロバイオームベースの抗生物質スチュワードシップレジメンに組み込むことは、広域抗生物質によるマイクロバイオームへの付随的ダメージを最小限に抑えるために不可欠である。従来の抗生物質に加え、腸内常在菌の多くは、ヒトを対象とした複数の非抗生物質薬によっても阻害される可能性がある66。今後、特にポリファーマシーを必要とする多疾病患者においては、このような予期せぬ薬剤の副作用を考慮する必要がある（表2）。このような革新的な化合物の系統的な同定と特性解析は、病原体のコロニー形成を予防または排除する新しい薬剤を発見するための有望な戦略となりうる。
臨床の現場では、抗生物質による治療戦略の大部分が広域スペクトル抗生物質に依存しており、この抗生物質は病原体だけでなく、ほとんどの常在菌にも大きな選択圧を課している。その結果、常在菌は耐性メカニズムの進化や病原体への耐性遺伝子の移入において重要な役割を担っている（図2）68。例えば、特定の宿主生物内であっても、広範な宿主域を持つ結合性プラスミドや導入ファージを介して、耐性遺伝子の種間水平移動が抗生物質治療中に頻繁に起こっているようである69。したがって、公衆監視システムは、主要な耐性菌の耐性クローンだけでなく、常在菌が主要な耐性菌として同定されれば、主要な常在菌の進化と拡散にも焦点を当てるべきである（表2）。
感染症研究に生態学的概念を導入することで、典型的な病原体のアキレス腱を特定するための重要な一歩を踏み出すことができる。このような病原体は、有益な常在菌や宿主防御エフェクターの拮抗メカニズムに対して病原体をより感受性にする、インテリジェントな抗適応性薬剤のターゲットとなる。このような標的は、病原体を単独で試験管内で増殖させるスクリーニングプログラムでは見つけることができない。マウスモデルはヒトに特異的な病原体を研究する上ではあまり意味がないことが多いため、コントロールされたヒトのチャレンジモデルが確立されている。まだ開発されていない抗ウイルス性化合物を用いて、このような病原性メカニズムを標的とすることで、病原体の伝染性や蔓延を抑えることができる（表2）。
微生物群の侵入性が、制御性T細胞や免疫グロブリンを含む生得的・適応的宿主防御機構の活性化に影響を及ぼすかどうか、またどのように影響を及ぼすかについては、現在ようやく解明されつつある。特異的抗原と細菌種によって、IgAはおそらく相反する役割を持つであろう。しかし、常在細菌と病原体は、時に重要な表面抗原を共有している76。このことは、免疫寛容を克服する細菌病原体に対する効果的なワクチンを開発する上での課題となりうる。病原体と常在菌の抗原エピトープに関する知識は、潜在的に病原性を持つマイクロバイオームのメンバーに対する予防的・治療的アプローチのための粘膜ワクチンの開発に役立つ（表2）。現在のところ、ESKAPE病原体のほとんどに対するワクチンは存在しない77。このため、常在菌の生態学的な誘導と免疫応答に基づいて、病原体を制御するための新たなアプローチを開発する必要がある。
貢献者
LM、CS-T、REL、HB-O、HL、NZ、SW、APがパーソナルビューの構想を練った。APが原案を執筆した。すべての著者が個人的見解の批判的レビューと編集を行った。
利害関係
競合する利益はないことを宣言する。
謝辞
Christoph Dehio氏には有益な議論を、Libera Lo Presti氏には原稿を批判的に読んでいただいた。すべての著者は、Cluster of Excellence EXC2124 Controlling Microbes to Fight Infection、プロジェクトID 390838134の助成を受けた。また、ドイツ研究財団（LM：Emmy Noether Programme number MA 8164/1-1、CS-T：STE 2964/5-1, STE 2964/5-1）からの助成金にも感謝する： STE 2964/5-1、STE 2964/6-1、SW: WA3299/5-1、AP： TRR156、プロジェクトID 246807620、SPP2330、プロジェクトID 465126486、HB-O、NZ、SW、APへ： TRR261プロジェクトID 398967434）、German Center for Infection Research（LM、CS-T、HB-O、NZ、SW、AP）、European Research Council（LM：プロジェクト番号101076967 - gutMAP、HL：ERC Starting Grant MapMe、助成金番号715650）、Max Planck Society（REL）より。
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論文情報
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出版 2024年04月09日
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DOI: https://doi.org/10.1016/S2666-5247(24)00049-1

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図
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図1常在細菌と病原性細菌の行動の連続性
図サムネイルgr2
図2常在菌、病原体、宿主間の複雑な相互作用
図サムネイルgr3
図3常在細菌病原体の宿主から宿主への伝播は感染によってどのように支えられているのか？
表
表1 ヒトに適応した職業的または偶発的病原体の例
表2細菌感染に対するマイクロバイオーム生態学的アプローチの展望
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