16S rRNA遺伝子シーケンスを用いた新生児集中治療室における早産児92例の1～60日後の腸内細菌叢の変化

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16S rRNA遺伝子シーケンスを用いた新生児集中治療室における早産児92例の1～60日後の腸内細菌叢の変化

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38018034/

Yuanyuan Chen et al. 2023.
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引用

要旨
背景 新生児の腸内環境の多様性は、出生時の条件やプロバイオティクス/抗生物質の使用によって影響を受ける。腸内細菌叢は脳の発達、免疫、疾患のリスクに影響する。早産児は、特に新生児集中治療室（NICU）において、満期産児とは異なる腸内細菌叢を有しており、これは胎内での微生物コロニー形成を示唆している。本研究では、中国のNICU早産児92例における腸内細菌叢の変化について検討した。材料および方法 出生直後にNICUに入院した早産児92人のデータを収集し、1、3、7、14、21、28、60日目に糞便サンプルを採取した。16S rRNAシークエンシングにより腸内細菌の変化を解析し、腸内細菌叢機能の経時的変化を予測し、早産児の腸内細菌に対する主食形態の影響を比較した。結果 動物門レベルでは、存在量の多い順に上位5門で合計99.69％を占めた： プロテオバクテリア、ファーミキューテス、アクチノバクテリア、テネリキューテス、バクテロイデーテスであった。属レベルでは、存在量の多い順に上位10属で合計90.90％を占めた： シュードモナス、スタフィロコッカス、クレブシエラ、エシェリヒア・シゲラ、分類不能の腸内細菌科、スタフィロコッカス、クロストリジウム・センス・ストリクト-1、ストレプトコッカス、スフィンゴモナス、ウレアプラズマであった。プロテオバクテリア（Proteobacteria）とシュードモナス（Pseudomonas）の菌量は、最初は減少傾向を示し、14日目に最小となり、その後増加傾向を示したが、ファーミキューテス（Firmicutes）では逆の傾向が観察された。細菌群集の代謝機能は各時点で大きく変化した。粉ミルク栄養児の門レベルのプロテオバクテリア（Proteobacteria）および属レベルのストレプトコッカス（Streptococcus）の存在量は、母乳栄養児よりも有意に高かった。結論 1～60日の間に，NICUの早産児の腸内細菌叢は哺乳パターンの変化とともに変化し，主な腸内細菌は門，プロテオバクテリア，シュードモナスであった。

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