シス因子

遺伝子の転写のタイミング、場所、量はそれぞれのシス配列に特異的に保存されている。
主に遺伝子の5'末端上流にコードされ、イントロンや3'末端下流の場合もある。
特別な例として、クラスター全体に影響する遺伝子座制御領域やエンハンサーの影響が周りに作用するのを遮断するインシュレーターがある。