デルタPlus 変異株と ラムダ変異株。新興株について知っておくべきこと
オーストラリアの名門大学であるモナッシュ大学の Sunil Lal 博士の記事。
Sunil Lal
Professor of Microbiology, School of Science, Monash University Malaysia
【 解説 】
現在デルタ変異株の広がりが問題視されています。デルタ株は、感染力が非常に強いため、英国では新型コロナの99%をデルタ株が占めています。
大量の新規感染者の割に死亡者数が少なく、強毒性ではないと考えられています。そのため英国は全ての予防規制を解除しています。
この記事では、デルタ株の亜種 デルタPlus とペルーで優位になっているラムダ株について解説されています。本文中に、
『デルタPlus変異体は、抗体カクテル（人工的に作られたモノクローナル抗体）に耐性があり、ACE2受容体に強く結合して伝達性を高め、COVID-19薬剤にも耐性を示し、ワクチン接種による免疫反応を回避する。』
と説明があり、デルタPlus変異株は、ワクチンに対する耐性を持つような変異株です。
ここで思い出すのが、抗生物質（メチシリン、バンコマイシンなど）に対する耐性菌が現れてきて、将来、使える薬剤がなくなってしまうという懸念があることです。変異株が出るたびに新しいワクチンを出しても良いのでしょうか？ ノーベル賞受賞者 リュック・モンタニエ博士は、パンデミックの最中にワクチンを使用するべきではないと述べています。
英国の新規感染者数と死亡者数のグラフ、現時点ではデルタ株は死亡率が低いことを示している。
RNAウイルスの新種の出現は珍しいことではなく、コロナウイルスも例外ではありません。ウイルスの複製が増えると、ウイルスに突然変異が起こる可能性が高くなり、その結果、新しい亜種が生まれるのです。
これらの新しい突然変異の大部分は無害です。しかし、その中には、より感染力を強めたり、人間の抗体反応を回避したりするように進化するものもあります。これは「収束進化」と呼ばれる現象で、過去のパンデミックの多くで観察されています。
SARS-CoV-2（COVID-19の原因ウイルス）は、急速に変異し、様々な変異を獲得しています。例えば、アルファ型は、オリジナルの武漢型に比べて感染力が50％増しています。
例えば、Alpha変異体は、元のWuhan株と比較して50%の感染力を持ち、Beta、Gamma変異体に続き、デルタ変異体はAlpha変異体と比較して60%の感染力を持ちます。デルタ型は、98カ国における「セカンドウェーブ」の主な原因となっています。
デルタプラス、ラムダ、そしてCOVIDの第3の波
現在、インド、英国、ポーランド、スイス、ポルトガル、ロシア、日本、ネパール、中国、カナダ、トルコ、米国など12カ国で出現しているデルタプラス亜種（B.1.617.2.1/AY.1）から「第3の波」が発生すると予想されています。
デルタPlus変異体は、抗体カクテル（人工的に作られたモノクローナル抗体）に耐性があり、ACE2受容体に強く結合して伝達性を高め、COVID-19薬剤にも耐性を示し、ワクチン接種による免疫反応を回避する。
デルタプラスの変異体が獲得した変異（K417N）は新しいものではなく、ベータの変異体にも存在していました。
ラムダ変異株（C.37またはB 1.1.1）は、早くも2020年12月にペルーのリマで検出されました。同国では、全症例の90％でこの変種が報告されています。現在、29以上の国でこの亜種が検出されています。
この変異株は、早期に検出されたものの、当初は感染率が低かったものの、現在ではペルーで優勢な変異株となっており、他の変異株よりも感染性や感染力で優位に立っていることが明らかになったことは注目に値します。
興味深いのは、この変異体には7つのシングルポイント変異と1つの欠失変異（タンパク質配列から数個のアミノ酸が失われている）があり、すべてスパイクタンパク質にあることです。スパイクタンパク質は、このウイルスの表面タンパク質であり、非常に抗原性が高く、人間のシステムが免疫を認識するための主要なターゲットであることを意味しています。
このラムダ変異体で欠失している配列は、この免疫認識を担うスパイクタンパク質の領域に対応しています。
したがって、新たに欠失したラムダ変異株は、ワクチン接種を受けた人の免疫逃避能力を高めている可能性があります。また、ラムダ変異株のスパイクタンパク質にある7点の変異のうち、2つ（L452QとL452R）は、抗体の逃避性を高め、その結果、抗体カクテルが効かなくなる可能性があります。
これらの要因はすべて、ラムダ変異株の感染力を高め、現在のワクチンの全体的な有効性を低下させる直接的な原因となっています。
したがって、新しい亜種の出現は自然な現象であり、マレーシアにデルタ、デルタ Plus、ラムダの各亜種が存在していても、驚くべきことではありません。新しい亜種は、保菌者や感染者によって他国から運ばれてくる必要はありません。感染したコホート内での複製の広範なサイクルから出現するのです。
ラムダコロナウイルス変異体-CSIRO：ラムダ変異体には折衷的な突然変異のセットがあり、その多くは免疫回避であるように見えます。つまり、ウイルスが人の免疫応答を回避できるようにします。
Lambda coronavirus variant - CSIRO: The Lambda variant has an eclectic set of mutations, many of which appear to be immune evasions — that is, allowing the virus to evade a person’s immune response. https://t.co/FTL1bXmxfJ
— @tetralympus (@dragonsaerie) July 15, 2021
マレーシアでの活動状況
マレーシアの現状を見ると、ウイルスが活発に増殖し、感染していることは明らかで、厳しいロックダウン対策の後、カーブを平準化するという私たちの予測を覆しています。
これらの新種のウイルスは、マレーシアの人口の中に存在する可能性があり、その感染力の強さから、検出されずにコミュニティ内で急速に広まっている可能性があります。
新しい変異体の発見は、配列に基づいたサーベイランス、実験室での研究、疫学調査に直接関係していることを理解する必要があります。
ロックダウン開始時には、毎日6000件以上の症例が検出されましたが、陽性症例の数は検査に直接比例します。
一方、変異体の検出は、感染したサンプルの配列決定に正比例します。ロックダウンにもかかわらず、感染者数が着実に増加しているところを見ると、ウイルスの感染動態が変化し、感染力や伝染力が向上していることは間違いなさそうです。これらは、上述した新しい亜種の特徴です。
ウイルスの全塩基配列に基づくサーベイランスや点変異の検出には、多くの発展途上国に不足している人材やインフラの専門性が必要です。そのため、新種のウイルスの早期発見が遅れ、その結果、効率的な感染速度により先行するウイルスを追い越すまで発見されないことがあります。
その結果、新しい亜種は、その効率的な感染率のために従来の亜種を追い越すまで検出されず、優勢になると検出が容易になります。ですから、ウイルスの配列決定後の変異の検出率を考えると、デルタプラスやラムダの変異を実際に検出するまでには、しばらく時間がかかるかもしれません。
このウイルスは人間の中にしっかりと入り込んでいるので、根絶することは不可能です。
世界保健機関（WHO）が「絶対になくならない」と述べているのは正しい。とはいえ、他の多くの既知の感染症との共存と同様に、この新しい感染症との共存方法を考えなければならない。
人類が "ほぼ "撲滅したウイルスはポリオだけであるが、これはこのウイルスがそれほど頻繁には変異しないという事実によって緩和されている。
原則として、ロックダウンはウイルスの無差別な拡散を阻止するのに有効ですが、経験上、この時間を利用して、医療機関は主にキャパシティビルディングと医療サプライチェーンに注力すべきだとも言われています。
ロックダウンが解除された後には、効率的に対処しなければならない症例が増加することが予想されます。
フェイスマスクと社会的距離を置くことがエアロゾルの拡散を抑制するのに役立つのは間違いなく、人混み、地下鉄、公共の場、食料品店、屋内の集まりなどで実施しなければなりません。
最近では、フランシス・クリック研究所の研究により、新たな亜種が増加していることから、同じワクチンの2回目の接種の必要性が断定的に強調されています。
The Lancet誌に掲載されたこの研究では、新たに発生した優勢な亜種に対する新しいワクチンの必要性が強調されています。
このような対策を講じても、新たな亜種が出現することに変わりはありませんが、それぞれの亜種から学び、新たに得られた情報を取り入れることができれば、過去の亜種よりも致死率は低くなるでしょう。
敵を倒すことができないのなら、敵と共存することを学ぼう」。
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