南アフリカで静かに広がりつつあるC.1.2変異株は、これまでに最も変異が多く免疫を回避する可能性がある
(記事タイトル)
C.1.2 変異株は感染力が強く、ワクチンの防御を回避する可能性がある。
【 解説 】
C.1.2 の病原性等の記述はありません。感染力が強いことから、今後世界中で感染が広まる可能性が有ります。
COVID-19の原因ウイルスであるSARS-CoV-2の新たな亜種が、南アフリカをはじめとする世界各国で検出されたことが明らかになった。
南アフリカ共和国の国立感染症研究所（NICD）およびクワズールー・ナタール研究革新・配列決定プラットフォーム（KRISP）の研究者らによると、今回問題となっている潜在的な変異型であるC.1.2が初めて検出されたのは、今年5月のことでした。その後、C.1.2は、8月13日現在、中国、コンゴ民主共和国、モーリシャス、イギリス、ニュージーランド、ポルトガル、スイスで発見されているとのことです。
8月24日にプレプリントリポジトリMedRxivに掲載された査読付きの研究によると、C.1.2は、南アフリカで発生したSARS-CoV-2の第1波の感染を支配した系統の1つであるC.1と比較して、大幅に変異しているという。
この新しい変異体は、これまでに世界中で検出された他のVOC（variant of concern）やVOI（variant of interest）よりも多くの変異があるという。研究者らは、C.1.2の入手可能な配列数は、南アフリカや世界におけるこの変種の広がりや頻度を過小評価している可能性があると指摘しています。
今回の研究では、南アフリカにおけるC.1.2のゲノム数が毎月一貫して増加しており、5月には配列決定されたゲノムの0.2％だったのが、6月には1.6％、7月には2％にまで増加していました。
「これは、早期発見時に国内のBetaおよびDeltaバリアントで見られた増加と同様である」と本研究の著者は述べています。
この研究によると、C.1.2系統の変異率は年間約41.8回で、現在の世界の他のバリアントの変異率の約2倍の速さです。
また、C.1.2系統の半数以上の配列には14の変異がありますが、一部の配列ではさらなる変異が認められます。「これらの変異はC.1.2ウイルスの大部分に生じているが、この系統のスパイク領域内にはさらなる変異があり、系統内進化が進行していることを示唆している」と、研究の著者らは指摘している。
C.1.2配列のスパイク領域の変異の約52％は、これまでに他のVOCやVOIでも確認されている。スパイクタンパク質は、SARS-CoV-2ウイルスがヒトの細胞に感染・侵入する際に使用されるもので、ほとんどのワクチンがこの領域を標的としている。また、C.1.2の配列には、特定の抗体からの免疫逃避に関連する変異N440KとY449Hが注目されている。
「これらの変異は、現在のVOC/VOIの特徴ではありませんが、特定のクラス3中和抗体からの逃避に関連しています」と著者らは記しています。
著者らは、これらの変異とウイルスの他の部分の変化が、ウイルスが抗体や免疫反応を回避するのに役立っている可能性が高いと指摘しています（αまたはβ変異体に対する抗体がすでにできている患者を含む）。
「C.1.2の表現型の特徴と疫学が明らかになりつつある中で、この系統の変異の組み合わせに注目することは重要である」と著者らは付け加えている。
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