書記のBioInfo日誌#4 mRNAとmiRNAについての情報収集（2021/05/03）

目的

mRNAとmiRNAについて調べる

参考：

siRNAとmiRNAの違いは何？RNA干渉(RNAi)に関する基礎知識 | Learning at the Bench

結果

参考文献：

「miR-133a Regulates Vitamin K 2,3-Epoxide Reductase Complex Subunit 1 (VKORC1), a Key Protein in the Vitamin K Cycle」

こちらの付表に，予測の結果が一覧で示されている。今回はこれにあるものから探索をしてみた。

まず，遺伝子のRefSeq IDを調べた→VKORC1

今回関係があるのは「NCBI Reference Sequences (RefSeq)」の欄である。

このうち，論文に書かれていたのは「NM_024006.6」であった。見てみると，いくつかの論文から報告されていることがわかる。

mRNA配列がこちら。

次に，miRNAのデータベースである「miRBase」にアクセスした。

試しに「hsa-miR-328」で検索した結果がこちらである。

本当は，mRNA配列からそれに作用するmiRNAを予測できれば良かったのだが，時間がなかったのでまたの機会にする。

本記事のもくじはこちら：

バイオインフォマティクスまとめ｜Writer_Rinka｜note