腸内細菌叢は急性COVID-19症候群の表現型と関連している

メインコンテンツへスキップメインメニューへスキップ
広告

インスピレーションを与える科学Cell Pressジャーナル
細胞宿主微生物
ログイン
メインメニュー
検索...

短報|32巻5号651-660.e4、2024年05月08日号

全号ダウンロード
腸内細菌叢は急性COVID-19症候群の表現型と関連している

https://www.cell.com/cell-host-microbe/abstract/S1931-3128(24)00122-7

蘇齊
ラファエラ I. ラウ
秦劉
プイ・クアン・チョン
フランシス・K・L・チャン
シュー・C・ウン 5
すべての著者を表示する

脚注を表示掲載:2024年4月23日DOI:https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.04.005

ハイライト

急性COVID-19症候群（PACS）患者の腸内細菌叢を解析した。

腸内細菌叢の組成はPACSの不均一性と関連する

腸内細菌型はPACSの明確な表現型と関連する。

マイクロバイオームベースのマルチラベル機械学習モデルはPACS症状を正確に予測する。
まとめ
急性COVID-19後症候群（PACS）の多くの表現型症状の根底にあるメカニズムは十分に理解されていない。ここで我々は、PACS患者の異種コホートにおける腸内細菌叢を特徴付け、微生物叢を用いて特定の症状を予測するためのマルチラベル機械学習モデルを開発した。我々の処理したデータは、585の細菌種と500の微生物経路をカバーし、PACSの個人間変動の12.7％を説明した。PACS患者において、3つの腸内細菌型が同定され、異なる表現型と関連した。訓練されたモデルは、テストセットにおけるPACSの個々の症状の予測において0.89の精度を示し、PACSを発症する前の独立した縦断的コホートにおける今後の症状の予測において86％の感度と82％の特異度を維持した。本研究は、腸内細菌叢がPACSの表現型症状と関連していることを示しており、PACSの予測および診断に臨床的有用性がある可能性がある。
図抄録
図サムネイルfx1
大きな画像を見る 高解像度画像をダウンロードする
キーワード
腸内細菌叢
ロングCOVID
メタゲノミクス
機械学習
ポスト急性COVID-19症候群
この記事の全文を読むには、支払いが必要です。
1回限りのアクセスを購入する：
アカデミック＆パーソナル：24時間オンラインアクセス
企業のR&Dプロフェッショナル：24時間オンラインアクセス
今すぐ読む
HTML記事全文へのアクセスを6時間または36時間、低料金でご購入いただけます。こちらをクリックしてください。

1回限りのアクセス料金
購読する
細胞宿主と微生物
既に印刷版を購読されていますか？オンラインアクセスを申請する
既にオンライン購読者ですか？サインイン
登録する アカウントを作成する
機関アクセス ScienceDirectにサインイン
参考文献
デイビスH.E.
マコーケルL.
ヴォーゲルJ.M.
Topol E.J.
ロングCOVID：主な知見、メカニズム、および推奨事項。
Nat. Rev. Microbiol. 2023; 21: 133-146
https://doi.org/10.1038/s41579-022-00846-2
論文で見る
スコープス (995)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ナルバンディアンA.
セガールK.
グプタ A.
マダヴァンM.V.
マクグローダーC.
スティーブンス J.S.
クック J.R.
ノルトビッグ A.S.
シャレブ D．
セーラワットT.S.
ほか
急性COVID-19後症候群。
Nat. Med. 2021; 27: 601-615
https://doi.org/10.1038/s41591-021-01283-z
論文で見る
スコープス(2607)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Huang L.
ヤオ Q.
Gu X.
Wang Q.
Ren L.
Wang Y.
Hu P.
Guo L.
Liu M.
Xu J.
他。
COVID-19による病院生存者の1年転帰：縦断的コホート研究。
Lancet. 2021; 398: 747-758
https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01755-4
論文で見る
スコープス (635)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
ボウ B.
クシー Y.
アル・アリZ.
COVID-19の2年後の急性後遺症。
Nat. Med. 2023; 29: 2347-2357
https://doi.org/10.1038/s41591-023-02521-2
論文で見る
スコープス (50)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
オマホニーL.L.
ルーテンA.
ギリーズC.
エケジーW.
ウェルフォードA.
チャン A.
カラムチャンダニ U.
シムズ＝ウィリアムズ N.
カッサンバイ S.
アルダバーニA.
他。
入院集団と非入院集団におけるロングコビッドの有病率と長期的健康影響： システマティックレビューとメタアナリシス。
EClinicalmedicine。2023; 55101762
https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2022.101762
記事で見る
スコープス(230)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
サターフィールド B.A.
バット D.L.
ガーシュB.J.
COVID-19の長期的影響における心臓の関与。
Nat. Rev. Cardiol. 2022; 19: 332-341
https://doi.org/10.1038/s41569-021-00631-3
論文で見る
スコープス (72)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ヴェンカタラマニV.
ウィンクラーF.
長いCovid-19における認知機能障害。
N. Engl. J. Med. 2022; 387: 1813-1815
https://doi.org/10.1056/NEJMcibr2210069
論文で見る
スコープス (38)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
メリンガー H.
メアンドル S．
COVID-19急性後胃腸症候群。
Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2022; 19: 345-346
https://doi.org/10.1038/s41575-022-00611-z
論文で見る
スコープス (44)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ケニー G．
マッキャン K.
オブライエンC.
オブローンC.
ティナゴ W.
ユセフ O．
オゴーマン T．
コッター A.G.
ランバート J.S.
フィーニー E.R.
他。
ワクチン接種と懸念される変異型が長いCOVIDの臨床表現型に及ぼす影響。
BMC Infect. Dis. 2023; 23: 804
https://doi.org/10.1186/s12879-023-08783-y
論文で見る
スコープス (1)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
マテュー L．
テベC.
ロステC.
サントス J.R.
リャドス G.
ロペス C.
エスパーニャ・クエト S.
トレド R.
フォント M.
チャモロ A.
他
COVID-19後遺症の発症と予後の決定因子：2年間の前向き観察コホート研究。
Lancet Reg. Health Eur. 2023; 33100724
https://doi.org/10.1016/j.lanepe.2023.100724
論文で見る
スコープス (8)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
Zhang F.
ラウ R.I.
リウ Q.
スー Q.
チャン F.K.L.
Ng S.C.
COVID-19における腸内細菌叢：重要な微生物の変化、潜在的メカニズム、臨床応用。
Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2023; 20: 323-337
https://doi.org/10.1038/s41575-022-00698-4
論文で見る
スコープス (62)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ペルーソ M.J.
ディークス S.G.
long-COVIDの病因に関する初期の手がかり。
Trends Immunol. 2022; 43: 268-270
https://doi.org/10.1016/j.it.2022.02.008
論文で見る
スコープス (63)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
クーンティ K.
デイビス M.J.
コシボロド M.N.
ナック M.A.
長いCOVID - 代謝危険因子と新規治療管理。
Nat. Endocrinol. 2021; 17: 379-380
https://doi.org/10.1038/s41574-021-00495-0
論文で見る
スコープス (35)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
王 C.
ラマサミーA.
ベルドゥスコ-グティエレスM.
ブロードW.M.
メラメド E.
SARS-CoV-2感染の急性・後遺症：危険因子と社会的決定要因のレビュー。
Virol. J. 2023; 20: 124
https://doi.org/10.1186/s12985-023-02061-8
論文で見る
スコープス (10)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リウ Q.
マックJ.W.Y.
スーQ.
Yeoh Y.K.
Lui G.C.
Ng S.S.S.
Zhang F.
Li A.Y.L.
Lu W.
Hui D.S.
他。
急性COVID-19症候群患者の前向きコホートにおける腸内細菌叢動態。
Gut. 2022; 71: 544-552
https://doi.org/10.1136/gutjnl-2021-325989
論文で見る
スコープス (170)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ヴェスタッドB.
ユーランドT.
レルム T.V.
ダール T.B.
ホルム K.
バラット・デュエ A.
コーシン T.
ディルホル・リーゼ A.M.
スティックスルッド B.
トンビーK.
他
重症COVID-19の3ヵ月後の呼吸機能障害は、腸内細菌叢の変化と関連している。
J. Intern. Med. 2022; 291: 801-812
https://doi.org/10.1111/joim.13458
記事で見る
スコープス (38)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デ・アルメイダV.M.
エンゲルD.
リッチM.F.
クルス C.S.
ロペス I.S.
アルヴェス D.A.
アウリオル M.d.
マガリャエス J．
ズッコリ G．
スミス B.J.
他
COVID-19患者由来の腸内細菌叢は、COVID後症候群に類似した変化をマウスに引き起こす。
Gut mircobes. 2023; 152249146
https://doi.org/10.1080/19490976.2023.2249146
論文で見る
スコパス (11)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
スー Q.
ラウ R.I.
リウ Q.
チャン F.K.L.
Ng S.C.
SARS-CoV-2排除後1年以上経過した急性COVID-19症候群と腸内細菌異常症。
Gut. 2023; 72: 1230-1232
https://doi.org/10.1136/gutjnl-2022-328319
論文で見る
スコープス (21)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チェン・L.
Wang D.
ガルマエワ S.
クリルシコフ A.
ヴィラ V.A.
ガセサ・R.
シンハ T.
セガール E.
ウィースマ R.K.
ウィメンガC.
他。
ヒト腸内細菌叢の長期的遺伝的安定性と個体特異性。
Cell. 2021; 184: 2302-2315.e2312
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.024
論文で見る
スコープス (145)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
バジェス・コロマーM.
バシガルペ R.
ヴィエイラ・シルバ S.
スズキ S.
ダルジ Y.
ティト R.Y.
山田哲也
セガタ N.
レーズ J.
ファロニーG.
複数家族世代にわたるヒト腸内細菌叢の変動と伝播。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 87-96
https://doi.org/10.1038/s41564-021-01021-8
論文で見る
スコープス (29)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リニネラ E.
ラウルP.
チントンニ M.
フランチェスキ F.
ミッジアーノ G.A.D.
ガスバリーニ A．
メレM.C.
健康な腸内細菌叢組成とは何ですか？年齢、環境、食事、および疾患にわたって変化する生態系。
微生物。2019; 7: 14
https://doi.org/10.3390/microorganisms7010014
論文で見る
スコパス (1733)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
マック・アオゲイン M.
ナーラーヤナJ.K.
ティウ P.Y.
アリ N.A.B.M.
ヨン V.F.L.
ジャギ T.K.
リム A.Y.H.
キアー H.R.
ディッカー A.J.
Thng K.X.
他。
気管支拡張症増悪における統合的マイクロバイオミクス。
Nat. Med. 2021; 27: 688-699
https://doi.org/10.1038/s41591-021-01289-7
論文で見る
スコープス (98)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
スー Q.
リウ Q.
Lau R.I.
Zhang J.
Xu Z.
Yeoh Y.K.
Leung T.W.H.
Tang W.
Zhang L.
Liang J.Q.Y.
他。
マルチクラス疾患診断のための糞便微生物ベースの機械学習。
Nat. Commun. 2022; 13: 6818
https://doi.org/10.1038/s41467-022-34405-3
論文で見る
スコープス (35)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ガンダ D．
ブッフ R.
マルチラベル分類に関する調査。
Recent Trends in Programming Languages. 2018; 5: 19-23
記事で見る
グーグル・スカラー
Wu S.
チェン Y.
Li Z.
Li J.
Zhao F.
Su X.
マルチラベル分類に向けて： マイクロバイオーム研究のための機械学習の次のステップ。
Comp. Struct. Biotechnol. J. 2021; 19: 2742-2749
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.04.054
論文で見る
スコープス (11)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
張 M.L.
Zhou Z.H.
マルチラベル学習アルゴリズムのレビュー。
IEEE Trans. Knowl. Data Eng. 2014; 26: 1819-1837
https://doi.org/10.1109/TKDE.2013.39
論文で見る
スコープス (2433)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ギバジャ E.
ベンチュラ S.
マルチラベル学習のチュートリアル。
ACM Comput. Surv. 2015; 47: 1-38
https://doi.org/10.1145/2716262
記事で見る
スコープス (449)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
リウ・N.N.
ジャオ N.
タンJ.C.
Wang Z.
Wu D.
Wang A.J.
Chen J.
Tao L.
Zhou C.
Fang W.
他。
多領域微生物叢解析により、コホート間で細菌-真菌相互作用と大腸癌のバイオマーカーが同定された。
Nat. Microbiol. 2022; 7: 238-250
https://doi.org/10.1038/s41564-021-01030-7
論文で見る
スコープス (92)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Bai F.
トマゾーニ D.
ファルシネッラ C.
バルバノッティ D.
カストルディ R.
ムレ G.
アウジェロ M.
モンダトーレ D.
アレグリーニ M.
コナ A.
他。
女性の性別は長いCOVID症候群と関連している：前向きコホート研究。
Clin. Microbiol. Infect. 2022; 28: 611.e9-611.e16
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2021.11.002
論文で見る
スコープス(223)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ツァンパシアンV.
エルガザリーH.
チャトパディヤイ R.
デブスキ M.
ナイン・T.K.P.
ガルグ P.
クラーク A.
Ntatsaki E.
ヴァシリウ V.S.
COVID-19後の状態に関連する危険因子： 系統的レビューとメタアナリシス。
JAMA Intern. Med. 2023; 183: 566-580
https://doi.org/10.1001/jamainternmed.2023.0750
論文で見る
スコープス (162)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
デ・ドメニコM.
COVID-19ワクチンの接種率が上昇すると長いCOVIDの有病率は低下する。
PLOS Glob。公衆衛生。2023; 3e0001917
https://doi.org/10.1371/journal.pgph.0001917
論文で見る
クロスリファレンス
グーグル・スカラー
ブラノック M.D.
チュー R.F.
プリス A.J.
ハドレー E.C.
レッドフィールド S.
マクマリー J.A.
リース P.J.
ガービン A.T.
クロスキー M.
周 A.G.
他
RECOVERプログラムのEHRに基づくコホート研究における長期COVIDリスクとCOVIDワクチン接種前。
Nat. Commun. 2023; 14: 2914
https://doi.org/10.1038/s41467-023-38388-7
論文で見る
スコープス (32)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ビャンバスレンO.
ステフリックP.
クラークJ.
アルコーンK.
グラスジウ P.
長期コビドに対するコビド-19ワクチン接種の効果：系統的レビュー。
BMJ Med. 2023; 2e000385
https://doi.org/10.1136/bmjmed-2022-000385
論文で見る
パブコメ
クロスフィルム
グーグル奨学生
モレッロ R．
マリアーニF.
マストラントーニL.
デ・ローズ C.
ザンピーノ G.
マンブリット D.
シグフリッドL.
ヴァレンティーニ P.
ブオンセンソD.
小児におけるCOVID-19後状態（Long Covid）の危険因子：前向きコホート研究。
EClinicalmedicine. 2023; 59101961
https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2023.101961
記事で見る
スコープス(34)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ヴィメルカーティL.
デ・マリア・L.
クアラート M.
Caputi A.
ゲスアルドL.
ミリオーレ G.
カヴォーネ D.
スポネッリ S.
ピポリ A.
インチンゴロF.
他。
長いCOVIDと過体重/肥満との関連。
J. 臨床。Med. 2021; 10: 4143
https://doi.org/10.3390/jcm10184143
論文で見る
スコープス (67)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
トンプソン E.J.
ウィリアムズ D.M.
ウォーカー A.J.
ミッチェル R.E.
ニエズヴィエツ C.L.
ヤン T.C.
ハギンズ C.F.
クウォン A.S.F.
シルバーウッド R.J.
ディ・ゲッサG.
他。
英国の10件の縦断的研究と電子カルテにおける長期のCOVID負担と危険因子。
Nat. Commun. 2022; 13: 3528
https://doi.org/10.1038/s41467-022-30836-0
論文で見る
スコープス (194)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
カリーナD.
ハルトゥングT.
マルダーレI.
ミトロイ M.
プーラス K.
ツァザキス A.
ロゴヴァーヌ I.
ドセア A.O.
COVID-19パンデミックとアルコール消費： 影響と相互関係。
Toxicol. 2021; 8: 529-535
https://doi.org/10.1016/j.toxrep.2021.03.005
論文で見る
スコープス (99)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
キム N.
腸内細菌叢の性差。
in： キム・N. 消化器疾患における性／性別特異的医療. シュプリンガー・ネイチャー・シンガポール, 2022: 363-377
https://doi.org/10.1007/978-981-19-0120-1_22
論文で見る
スコープス (9)
参考文献
グーグル奨学生
エンゲン P.A.
グリーンS.J.
ヴォイト R.M.
フォーサイス C.B.
ケシャヴァルジアンA.
消化管マイクロバイオーム： アルコールが腸内細菌叢の組成に及ぼす影響。
アルコール研究 2015; 37: 223-236
論文で見る
PubMed
グーグル奨学生
レオン・J.S.M.
腸内細菌叢とCOVID-19およびそのワクチンとの相互作用。
World J. Gastroenterol. 2022; 28: 5801-5806
https://doi.org/10.3748/wjg.v28.i40.5801
論文で見る
スコープス (4)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Li J.
ゴーシュ T.S.
マッキャンR.
マロンP.
ヒル C.
ドレイパー L．
シュルト D．
ファニング L．
シャノン R．
サドリエC.
他。
COVID-19重症度との頑健なクロスコホート腸内細菌叢の関連。
腸内細菌。2023; 152242615
https://doi.org/10.1080/19490976.2023.2242615
論文で見る
スコープス(4)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
リウ・B.N.
リウ・X.T.
Liang Z.H.
Wang J.H.
肥満における腸内細菌叢。
World J. Gastroenterol. 2021; 27: 3837-3850
https://doi.org/10.3748/wjg.v27.i25.3837
論文で見る
スコープス (165)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ラウ R.I.
スー Q.
ラウ I.S.F.
チン J.Y.L.
ウォン M.C.S.
ラウ L.H.S.
トゥン・H.M.
モク C.K.P.
チャウ S.W.H.
Tse Y.K.
他
香港における急性COVID-19症候群後のシンバイオティクス製剤（SIM01）（RECOVERY）：無作為化二重盲検プラセボ対照試験。
Lancet Infect. Dis. 2024; 24: 256-265
https://doi.org/10.1016/S1473-3099(23)00685-0
論文で見る
スコパス(3)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
マザーズ A.J.
クルックD.
ヴォーン A.
バリー K.E.
ベゲサナ K.
ストエッサー N.
パリク H.I.
セブラ R.
コタイ S.
ウォーカー A.S.
シェパード A.E.
Klebsiella quasipneumoniaeによるカルバペネマーゼ遺伝子導入、プラスミド再編成、および患者と病院環境との相互作用の解明。
Antimicrob. Agents Chemother. 2019; 63e02513-18
https://doi.org/10.1128/AAC.02513-18
論文で見る
スコープス (41)
Crossref
グーグル・スカラー
フェデリーチ S.
クレド＝ルッソS.
バルデス-マスR.
Kviatcovsky D.
ワインストック E.
マチューヒン Y.
シルバーバーグ Y.
アタラシ K.
古市美和
岡 A.
他
腸炎症治療のためのファージコンソーシアによるヒトIBD関連腸内常在菌の標的的抑制.
Cell. 2022; 185: 2879-2898.e24
https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.07.003
論文で見る
スコープス(158)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
クロスト E.H.
コレットE.
ベル A.
ジュゲ N.
ルミノコッカス・グナバス：ヒトの健康にとって敵か味方か。
FEMS Microbiol. Rev. 2023; 47fuad014
https://doi.org/10.1093/femsre/fuad014
記事で見る
スコパス (34)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Liśkiewicz A.
Przybyła M.
Wojakowska A.
Marczak Ł.
ボグス K.
ノヴァチャ＝チミエレフスカ M.
Liśkiewicz D.
マウェツキ A.
バルスキ J.
ルーイン＝コワリク J.
トボレク M.
身体活動は不安を軽減し、脳脂肪酸合成を制御する。
モル。Brain. 2020; 13: 62
https://doi.org/10.1186/s13041-020-00592-7
論文で見る
スコープス (13)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
チャン Y.
フィリウ M.D.
レッコウ S.
ゴーマンズP.
マッカローネG.
ケスラー M.S.
フランク E．
ハンブシュ B．
ホルスボア F．
ランドグラフ R．
タークC.W.
形質不安モデルマウスのプロテオミクスおよびメタボロームプロファイリングから、影響を受ける経路が示唆された。
Mol. Cell. プロテオミクス。2011; 10M111.008110
https://doi.org/10.1074/mcp.M111.008110
論文で見る
スコープス (76)
要旨
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
デ・フォス W.M.
ティルグ H.
ヴァン・フルM.
カニP.D.
腸内細菌叢と健康：メカニズム的洞察。
腸。2022; 71: 1020-1032
https://doi.org/10.1136/gutjnl-2021-326789
論文で見る
スコープス (667)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Gomaa E.Z.
健康および疾患におけるヒト腸内細菌叢／マイクロバイオーム：総説。
Antonie van Leeuwenhoek. 2020; 113: 2019-2040
https://doi.org/10.1007/s10482-020-01474-7
論文で見る
スコープス (483)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
カンマロータG.
イアニーロG.
アハーンA.
カルボーンC.
テムコ A.
クレッソン M.J.
ガスバリーニ A．
トルトラG.
がんの精密医療を推進するための腸内マイクロバイオーム、ビッグデータ、機械学習。
Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 2020; 17: 635-648
https://doi.org/10.1038/s41575-020-0327-3
論文で見る
スコープス (172)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ボルジャーA.M.
ローゼM.
Usadel B.
Trimmomatic: イルミナ配列データ用の柔軟なトリマー。
Bioinformatics. 2014; 30: 2114-2120
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu170
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ラングミードB.
サルツバーグ S.L.
Bowtie 2による高速ギャップドリードアライメント。
Nat. Methods. 2012; 9: 357-359
https://doi.org/10.1038/nmeth.1923
論文で見る
スコープス (32222)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ブランコ-ミゲスA.
ベギーニF.
クンボF.
マカイバー L.J.
トンプソン K.N.
ゾルフォ M.
マンギ P.
デュボア L.
ホアン・K.D.
トーマス A.M.
et al.
MetaPhlAn 4を用いた未同定種のメタゲノム分類学的プロファイリングの拡張と改善。
Nat. Biotechnol. 2023; 41: 1633-1644
https://doi.org/10.1038/s41587-023-01688-w
論文で見る
スコープス (113)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ベギーニ F．
マカイバーL.J.
ブランコ-ミゲスA.
デュボアL.
アスニカー F.
マハルジャン S.
メイリヤンA.
マンギ P.
ショルツ M.
トーマスA.M.
他
多様な微生物群集の分類学的、機能的、株レベルのプロファイリングをbioBakery 3で統合。
eLife. 2021; 10e65088
https://doi.org/10.7554/eLife.65088
論文で見る
スコープス (652)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ファンデンブーガートK.G.
トロサナデルガドR.
"compositions"： 組成データを分析するための統一されたRパッケージ。
Comput. Geosci. 2008; 34: 320-338
https://doi.org/10.1016/j.cageo.2006.11.017
論文で見る
スコープス (342)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
オクサネン J.
キントR.
レジャンドル P.
オハラ B.
スティーブンス M.H.H.
オクサネン M.J.
サジェスチョンM.
ビーガンのパッケージ。
コミュニティEcol。パッケージ。2007; 10: 719
記事で見る
Google Scholar
マリック H.
ラーナバード A.
マカイバーL.J.
マー S.
チャン Y.
グエン L.H.
ティックル T.L.
ワインガート G.
レン B.
シュワッガー E.H.
他。
集団規模のメタオミクス研究における多変量関連発見。
PLoS Comput. Biol.
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009442
論文で見る
スコープス (586)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ティンリー D.
山本貴之
廣瀬和彦
キールL.
今井和彦
Mediation： 因果調停分析のためのRパッケージ。
J. Stat. Software. 2014; 59: 1-38
https://doi.org/10.18637/jss.v059.i05
記事で見る
スコープス (2029)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
リボッリA.
デ・カルバーリョ A.C.P.L.F.
utimlパッケージ： R におけるマルチラベル分類。
R J. 2018; 10: 24
https://doi.org/10.32614/RJ-2018-041
記事で見る
スコープス (13)
Crossref
グーグル奨学生
リエウ A.
Wiener M.
randomForestによる分類と回帰。
R News. 2002; 2: 18-22
記事で見る
Google Scholar
Chen T.
ゲストラン C.
XGBoost： スケーラブルなツリーブーストシステム。
in： Proceedings of the 22nd ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining. Association for Computing Machinery, 2016： 785-794
https://doi.org/10.1145/2939672.2939785
論文で見る
スコープス (23702)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ランベール N.
コルプスS.
エルアザブ S.A.
ラムラキーニ N.S.
バリサノ A.
ユー L．
テイラー K．
エスペランカ A.
ダウンズ C.A.
アブラヒムH.L.
COVID-19 SARS-CoV-2（PASC）感染急性後遺症の時期、期間、健康影響に関する生存者の報告。
medRxiv. 2021; (Preprint at)
https://doi.org/10.1101/2021.03.22.21254026
論文で見る
スコープス (0)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ランバート N.J.
コルプスS.
COVID-19「長距離輸送車」症状調査報告書。
(インディアナ大学医学部による報告、2020年7月）2020年
記事で見る
Google Scholar
Chen Z.
ホイ P.C.
ホイ M.
イェオ Y.K.
ウォン P.Y.
チャン M.C.W.
ウォン M.C.S.
ウン S.C.
チャン F.K.L.
チャン P.K.S.
腸内細菌叢プロファイリングにおける保存方法と16S rRNA超可変領域の影響。
mSystems. 2019; 4e00271-00218
https://doi.org/10.1128/mSystems.00271-18
論文で見る
Crossref
グーグル・スカラー
記事情報
出版履歴
出版 2024年4月23日
受理 受理：2024年4月1日
改訂版受理 2024年2月28日
受理：2024年2月28日 受理：2023年11月29日
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2024.04.005

著作権
© 2024 Elsevier Inc. 無断複写・転載を禁じます。
サイエンスダイレクト
ScienceDirectでこの論文にアクセスする
この論文では、「哺乳類は、哺乳類である。このような研究は、科学的根拠を欠くものである。このような、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で。このような試合では、このような試合はありません。このような稚魚は、その稚拙な形から、稚魚の体躯を形成している。このような素晴らしい試合は初めてです。私は、このような素晴らしいゲームをプレイすることはできません。 このような素晴らしい試合は初めてです。このような稚魚は、そのような稚拙な稚魚である可能性があります。
関連記事
全文を見る
広告掲載

研究ジャーナル
細胞
癌細胞
細胞化学生物学
細胞ゲノム
細胞宿主と微生物
細胞代謝
細胞レポート
セルレポーツ医学
セルレポーツ・メソッド
セルレポート 物理科学
細胞幹細胞
細胞システム
化学
化学触媒
カレントバイオロジー
発生細胞
ヘリオン
免疫
アイサイエンス
ジュール
物質
医学
分子細胞
ニューロン
一つの地球
パターン
STARプロトコル
構造
トレンドレビュージャーナル
生化学
バイオテクノロジー
癌
細胞生物学
化学
認知科学
生態学・進化学
内分泌学・代謝学
遺伝学
免疫学
微生物学
分子医学
神経科学
寄生虫学
薬理学
植物科学
パートナージャーナル
AJHG
生物物理ジャーナル
生物物理学レポート
EBioMedicine
HGGアドバンス
分子植物
分子療法ファミリー
植物通信
幹細胞レポート
イノベーション
著者
論文投稿
複数ジャーナルへの投稿
STARメソッド
プレビュー - プレプリント

査読者
査読者向け情報

ニュース＆イベント
ニュースルーム
細胞シンポジウム
コンソーシアムハブ
ウェビナー
ラボリンク

マルチメディア
セルプレスポッドキャスト
セルプレスビデオ
カラーリングとコミック
フィギュア360
セル画ショー
研究篇
セルプレスについて
セルプレスについて
オープンアクセス
COVIDハブ
持続可能性
インクルージョンと多様性

コンタクト
お問い合わせ
ヘルプ＆サポート

採用情報
セルプレス採用情報
サイエンティフィックジョブボード
アクセス
登録する
請求
今すぐ読む
司書に推薦する
出版アラート
コレクション
ベスト・オブ・セルプレス
セルプレスレビュー
セルプレスセレクション
Nucleusコレクション
スナップショット・アーカイブ
インフォメーション
広告主の皆様へ
リクルーターの方へ
図書館員の方へ
プライバシーポリシー
ご利用条件
アクセシビリティ
本サイトのコンテンツは、あらゆる分野の医療従事者および研究者を対象としています。

当サイトでは、サービスの提供・向上やコンテンツのカスタマイズのためにクッキーを使用しています。クッキーの設定を更新するには、このサイトのクッキー設定をご覧ください。
このサイトのすべてのコンテンツ： 著作権 © 2024 Elsevier Inc.
テキストマイニング、データマイニング、AIトレーニング、および同様の技術に関するものも含め、すべての権利はエルゼビア社に帰属します。
すべてのオープンアクセスコンテンツには、クリエイティブ・コモンズのライセンス条件が適用されます。

プライバシーポリシー 利用規約 アクセシビリティ ヘルプ＆サポート お問い合わせ
RELX