「ChatGPT for CRISPR」　新しい遺伝子編集ツール

最近、「ChatGPT for CRISPR」という新しい遺伝子編集ツールについての記事が発表されました。これは、AIを用いて新しいCRISPRタンパク質を設計する革新的なアプローチを紹介するものです。以下はその概要です。

背景

CRISPRは元々、細菌がウイルスに対抗するために進化したシステムですが、研究者たちはこれを使って任意の遺伝子を精密に編集する方法を開発しました。これにより、医学や農業など多くの分野で大きな進展が見られました​ (Bakar Labs)​​ (Freethink)​。

新しいアプローチ

Berkeleyに拠点を置くスタートアップ企業Profluentは、AIを利用してこれまでに見たことのない新しいCRISPRタンパク質を設計しました。このアプローチは、ChatGPTのような生成AIモデルを使用し、遺伝子編集に必要な特定の機能を持つタンパク質を生成します。具体的には、AIモデルに対して必要な属性と機能を入力し、カスタマイズされた機能的な配列を生成することができます​ (Freethink)​。

ChatGPT と CRISPR の連携で遺伝子編集

実験結果

Profluentの研究チームは、AIが設計したCRISPRシステムの一つであるOpenCRISPR-1を用いて、人間のDNAを編集することに成功しました。この新しいシステムは、既存のCRISPR-Cas9酵素と同等の効率で標的DNA配列を切断し、誤った場所での切断が少ないことが確認されました。また、OpenCRISPR-1をベースにしたベースエディターも、他のベースエディティングシステムと同様に高効率であり、エラーが少ないことがわかりました​ (Nature)​​ (Bakar Labs)​。

https://www.nature.com/articles/d41586-024-01243-w　より引用

将来的な応用

AIで設計された遺伝子編集ツールは、既存のCRISPRに比べて医療用途により適している可能性があります。Profluentは、この技術を用いて遺伝子編集療法を開発している企業と提携し、AI生成のCRISPRを試験する予定です。また、OpenCRISPR-1はオープンソースとして公開されており、研究者が自由に利用できるようになっています​ (Bakar Labs)​​ (Freethink)​。

この新しい技術は、遺伝子編集の精度と効率を向上させ、医療や他の分野での応用が期待されます。詳細については、Natureの記事を参照してください。